Come trovare la sequenza degli aminoacidi

Cos'è l'amminoacido

Gli amminoacidi sono gli elementi costitutivi di base di tutte le proteine ​​nel nostro corpo. Può essere un ormone, un enzima, una proteina strutturale come la cheratina, tutti questi sono costituiti da amminoacidi. Gli amminoacidi polimerizzano per produrre proteine. Poiché ogni amminoacido ha un'estremità di base -NH2 e un'estremità acido -COOH, questi terminali reagiscono l'uno con l'altro formando una catena di amminoacidi che è chiamata polipeptide. Un polipeptide può contenere una varietà di amminoacidi. A seconda dell'ordine di amminoacidi noto anche come sequenza aminoacidica, le proteine ​​possono differire l'una dall'altra. Il sequenziamento è della massima importanza perché determina se la proteina funziona correttamente o meno.

Gli amminoacidi non polimerizzano casualmente. Questo processo è altamente regolamentato. Il codice di ciascuna proteina viene memorizzato in una sequenza di DNA che viene prima trascritta in una sequenza di m-RNA (negli organismi superiori il DNA viene giuntato prima di convertirsi in m-RNA dove vengono rimosse le sequenze indesiderate di DNA che si trovano tra i geni) e quindi m- L'RNA è tradotto in una sequenza di amminoacidi. 

(A = Adenina, T = Timina, G = Guanina, C = Citosina, U = Uracile in m-RNA t è sostituita da U)

Se consideriamo il DNA come un alfabeto a quattro lettere e può fare tre lettere, queste tre lettere sono chiamate codoni. Ognuno di questi codoni rappresenta un particolare amminoacido. Pertanto, se viene fornita una sequenza di DNA o una sequenza di m-RNA, possiamo essere in grado di predire la sequenza di amminoacidi. Il vero problema è che dal momento che il DNA è una matrice lineare di informazioni dovremmo avere alcune regole per iniziare e fermarsi nella giusta posizione.

Pochi passi per trovare la sequenza di amminoacidi

• PASSO 1  - Conoscere quale filamento di DNA è dato. Ci sono due filoni: il filo di codifica o il filo non codificante.

 

Si può leggere il filo di codifica da 3 'a 5' o leggere il filo modello da 5 'a 3' quando si crea il filamento m-RNA corrispondente.

• PASSO 2 - Scrivi il filamento m-RNA corrispondente.

Usando il codice Coding: (A = U, T = A, G = C, C = G) Leggi da sinistra a destra

Usando il modello strand: (T = U) Leggi da sinistra a destra

Possiamo vedere che otteniamo la stessa sequenza indipendentemente dal filo utilizzato.

• PASSAGGIO 3 - Converti m-RNA come una sequenza di codoni. Inizia SEMPRE dal codone AUG e non contare MAI lo stesso nucleotide due volte!

• PASSO 4 - Usa la tabella qui sotto per trovare la sequenza aminoacidica rilevante.

Inoltre ricorda,
un. Inizia codone AUG sta per Metionina.
b. Se si incontra un codone di arresto UAA, UGA, UAG, è necessario interrompere il sequenziamento.

Controlla se finisci con la risposta mostrata di seguito:

Met- Leu- Asp- Val- Phe-STOP