Differenza tra avanti e retromarcia

Differenza chiave - Avanti vs Reverse Primer
 

La reazione a catena della polimerasi (PCR) è un metodo di amplificazione del DNA che viene utilizzato nelle applicazioni biologiche molecolari. È una tecnica comunemente usata che produce milioni di miliardi di copie di una sequenza di DNA particolarmente interessata. È un in vitro metodo eseguito nei laboratori. La tecnica PCR è totalmente dipendente dalla DNA polimerasi prodotta in commercio, chiamata Taq polimerasi. E richiede anche diversi altri componenti e una corretta manutenzione della temperatura. Un componente importante è i primer. I primer sono le sequenze di DNA corte specificamente progettate per la sequenza di DNA target. Di solito sono circa 20 nucleotidi in lunghezza. Taq polimerasi catalizza l'aggiunta di nucleotidi nella sequenza nucleotidica preesistente. Quindi, i primer sono serviti come punti di partenza della sintesi di nuovi filoni. La Taq polimerasi funziona solo in direzione da 5 'a 3', quindi la sintesi del DNA avviene nella stessa direzione da 5 'a 3'. Poiché il DNA è a doppio filamento, sono necessari due tipi di primer nella PCR. Sono noti come primer forward e reverse primer. I primer forward e reverse sono definiti in base alla direzione dell'allungamento del primer nel DNA quando si verifica la sintesi del DNA. Il primer diretto si ricopre con il filo antisenso del DNA e avvia la sintesi del filamento + ve del gene nella direzione da 5 'a 3'. Il primer inverso si ricopre con il filo sensibile e avvia la sintesi del filo complementare del filo codificante; che è -ve il filo del gene in direzione 5'to 3 '. Questo è il differenza fondamentale tra primer avanti e retromarcia.

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è un Forward Primer
3. Che cos'è un Reverse Primer
4. Somiglianze tra iniettore avanti e retromarcia
5. Confronto affiancato - In avanti o inverso in forma tabulare
6. Sommario

Cos'è un Forward Primer?

L'orientamento in avanti è la sintesi del filamento codificante o del filamento sensoriale di un gene. Taq polimerasi catalizza la sintesi di un nuovo filamento in direzione 5 'a 3'. La sintesi del filo di codifica si verifica quando il primer si ricollega con il non codificante o il filo antisenso e si allunga in direzione 5 'a 3'.

Figura 01: primer avanti e indietro

Il primer che ricopre con il filamento antisenso o il filamento non codificante o il filo del modello è noto come primer diretto poiché il primer diretto funge da punto di partenza per la sintesi della codifica o del filamento positivo del gene. Il primer forward ha una sequenza nucleotidica breve che è complementare all'estremità fiancheggiante del trefolo antisenso. Si ibrida con il filo antisenso e facilita la Taq polimerasi per aggiungere nucleotidi che sono complementari al filo modello.

Che cos'è un Reverse Primer?

Il primer inverso è la breve sequenza di DNA che ricopre con l'estremità 3 'del senso o il filo codificatore. Il primer inverso serve come punto di partenza per sintetizzare un filamento complementare della sequenza di codifica o della sequenza non codificante. Il primer inverso è progettato in modo complementare all'estremità 3 'del codice. Quindi, si ricopre con l'estremità di 3 'che fiancheggia il filo di codifica e consente alla Taq polimerasi di sintetizzare il filamento antisenso o il filo del modello. Poiché il suo orientamento è invertito, questo primer è etichettato come primer inverso.

Entrambi i primer reverse e forward sono importanti per la produzione di milioni di miliardi di copie di particolari regioni di DNA che sono mirate o interessate.

Quali sono le somiglianze tra iniettore avanti e retromarcia?

• Entrambi i primer Forward e Reverse sono fatti da oligonucleotidi.
• Entrambi i primer diretti e inversi possiedono una sequenza nucleotidica breve complementare alle estremità fiancheggianti dei doppi filamenti del DNA.
• Entrambi i primer Forward e Reverse di solito consistono in 20 nucleotidi.
• Sia i primer diretti che quelli inversi vengono utilizzati nelle reazioni a catena della polimerasi.
• Sia i primer diretti che quelli inversi vengono sintetizzati in commercio.
• Entrambi i primer Forward e Reverse sono termicamente stabili e hanno normalmente Tm simile.
• Sia i primer diretti che quelli inversi sono ricotti con le sequenze target di DNA.
• Sia il Forward che il Reverse Primer sono progettati in base alle reazioni PCR.
• Sia i forward che i reverse forward sono serviti come punti di partenza per l'amplificazione del DNA.
• Entrambi i primer reverse e forward sono importanti per la produzione di milioni di copie di particolari regioni di sequenze di DNA mirate o interessate.

Qual è la differenza tra Forward e Reverse Primer?

Forward Primer vs Reverse Primer
Il primer diretto è la breve sequenza di DNA che si ibrida con l'estremità 3 'del non codificante o il filamento modello del gene e serve come punto di partenza per sintetizzare la sequenza di codifica.	Il primer inverso è la breve sequenza di DNA che si ibrida con l'estremità 3 'della codifica o il filamento nontemplato e serve come punto di partenza per sintetizzare la sequenza non codificante.
Strand di ricottura
Iniettore anteriore ricopre con il filo della maschera.	Il primer inverso si ricopre con il filamento nontemplato.
Nuova sequenza risultante
Il primer forward facilita la sintesi della sequenza di codifica.	Il primer inverso facilita la sintesi della sequenza non codificante.

Riepilogo - Inoltra vs Reverse Primer

Esistono due tipi di primer coinvolti nella tecnica di PCR. Sono primer avanti e indietro. Sulla base dell'allungamento del primer nella nuova sintesi di filamenti di DNA, questi primer sono etichettati o denominati. Taq polimerasi sintetizza il nuovo DNA in orientamento 5 'a 3'. Quindi, i primer sono progettati come complementari alle estremità 3 'dei doppi fili. Il primer forward che si allunga in direzione da 5 'a 3' si ibrida con l'estremità 3 'dell'antisenso o del modello o della sequenza non codificante. Serve come punto di partenza per sintetizzare la sequenza di codifica. Il primer inverso che si allunga in direzione da 5 'a 3' si ibrida con l'estremità 3 'della codifica o del nontemplate o del filo sensibile. Serve come punto di partenza per sintetizzare la sequenza non codificante. Questa è la differenza tra primer forward e reverse.

Riferimento:

1. "Primer (Molecular biology)." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 20 febbraio 2018. Disponibile qui 
2. "Polymerase chain reaction (PCR)." Khan Academy. Disponibile qui 

Cortesia dell'immagine:

1.'Primers RevComp Melted2' By Richard Wheeler (Zephyris) - Opera propria, (CC BY-SA 3.0) attraverso Commons Wikimedia