Qual è la differenza tra RNA Splicing e Splicing alternativo

Il differenza principale tra splicing RNA e splicing alternativo è quello Lo splicing dell'RNA è il processo di splicing degli esoni del trascritto primario dell'mRNA mentre lo splicing alternativo è il processo di produzione di combinazioni differenziali di esoni dello stesso gene. Inoltre, lo splicing dell'RNA è responsabile della produzione di una molecola di mRNA che può essere tradotta in una proteina mentre lo splicing alternativo è responsabile della produzione di una gamma di proteine ​​dalla stessa trascrizione primaria.

Lo splicing dell'RNA e lo splicing alternativo sono due tipi di modifiche post-trascrizionali che seguono la trascrizione dei geni eucariotici. Entrambi sono importanti per la produzione di una proteina funzionale.

Aree chiave coperte

1. Cos'è l'RNA Splicing
     - Definizione, processo, importanza
2. Cos'è lo splicing alternativo
     - Definizione, processo, importanza
3. Quali sono le somiglianze tra splicing RNA e splicing alternativo
     - Profilo delle caratteristiche comuni
4. Qual è la differenza tra RNA Splicing e Splicing alternativo
     - Confronto tra le principali differenze

Parole chiave

Splicing alternativo, esoni, introni, modifiche post-trascrizionali, splicing RNA

Cos'è l'RNA Splicing

Lo splicing dell'RNA è il processo biologico che rimuove gli introni dalla trascrizione primaria dell'RNA mentre lega gli esoni insieme negli eucarioti. Nell'uomo, la lunghezza media di un gene è di 30.000 paia di basi, ma la lunghezza di una molecola matura di mRNA è inferiore a 20.000 coppie di basi. Lo splicing dell'RNA è responsabile di questa riduzione della lunghezza media della molecola dell'mRNA. La funzione principale del processo di splicing dell'RNA è la produzione di una molecola matura di mRNA dal trascritto RNA primario, che può essere tradotto in una proteina funzionale.

Figura 1: RNA Splicing

Generalmente, ogni introne inizia con a GU e termina con un AG nella direzione 5 'a 3'. Il primo è il sito di donatori splicing mentre il secondo è il sito accettore splicing. Un terzo sito chiamato il sito di succursale si verifica 20 - 50 basi a monte del sito accettore con una sequenza di consenso del sito di ramo "CU (A / G) A (C / U)", dove A è conservato in tutti i geni. Questi tre siti sono noti collettivamente come segnali di splicing. Inoltre, la sequenza di esoni del sito donatore è (A / C) AG nella maggior parte dei casi e la sequenza di esoni nel sito accettore è G.

Figura 2: Meccanismo in due fasi di RNA Splicing

Cinque molecole di snRNA e le loro proteine ​​associate formano una proteina ribonucleare chiamata splicosome, che è un grande complesso (60S). Lo splicosoma è responsabile della rimozione degli introni dal trascritto dell'RNA primario in un processo a due fasi. nel frattempo, Splicing costitutivo è il meccanismo di splicing dell'RNA generale.

Cos'è lo splicing alternativo

Lo splicing alternativo è il processo biologico responsabile della produzione di varianti di molecole di mRNA da un particolare trascritto di RNA primario di un particolare gene. Questo significa; l'espressione di un singolo gene può provocare più proteine ​​con l'aiuto di splicing alternativo. Pertanto, queste molecole mature di mRNA possono mancare di alcuni degli esoni nel trascritto dell'RNA primario. Poiché la sequenza di amminoacidi di queste proteine ​​differisce l'una dall'altra, esse esercitano funzioni biologiche diverse all'interno della cellula. Sebbene il genoma umano consista di 25.000-35.000 geni codificanti proteine, oltre 90.000 di proteine ​​sono sintetizzate come risultato di splicing alternativo. Inoltre, più proteine ​​sintetizzate da un particolare trascritto di RNA sono chiamate isoforme proteiche.

Figura 3: Splicing alternativo Overveiw

Esistono cinque modalità di base di splicing alternativo. Loro sono il esone skipping o esone alternativo a cassetta, esoni che si escludono a vicenda, sito di splicing alternativo 3 ', sito di splicing alternativo 5', e ritenzione introne. Il modello prevalente di splicing alternativo nei vertebrati e negli invertebrati è il salto dell'esone. Nei metazoi più bassi, è la conservazione degli introni.

Figura 4: Meccanismi di splicing alternativo

Somiglianze tra splicing RNA e splicing alternativo

• Lo splicing dell'RNA e lo splicing alternativo sono due tipi di modifiche post-trascrizionali che si verificano durante l'espressione del gene eucariotico.
• Tuttavia, la molecola effettrice per entrambi i processi è il trascritto RNA primario.
• Inoltre, entrambi coinvolgono nello splicing degli esoni rimuovendo gli introni.
• Inoltre, entrambi sono responsabili della produzione di una molecola di mRNA, che può tradursi in una proteina funzionale.
• Inoltre, entrambi i processi si verificano all'interno del nucleo.

Differenza tra splicing RNA e splicing alternativo

Definizione

Lo splicing dell'RNA si riferisce a una modifica della nascente trascrizione dell'RNA pre-messaggero (pre-mRNA) in cui gli introni vengono rimossi e gli esoni vengono uniti prima della traduzione. Mentre lo splicing alternativo si riferisce a un processo che consente a un RNA messaggero (mRNA) di dirigere la sintesi di diverse varianti proteiche (isoforme) che possono avere diverse funzioni o proprietà cellulari. Queste definizioni spiegano la differenza fondamentale tra splicing di RNA e splicing alternativo.

Funzione

Lo splicing dell'RNA giunge gli esoni del trascritto dell'RNA primario mentre lo splicing alternativo giunge gli esoni nel trascritto dell'RNA primario, formando combinazioni differenziali di esoni. Quindi, questa è la differenza funzionale tra splicing RNA e splicing alternativo. 

esoni

Inoltre, l'mRNA maturo prodotto dallo splicing dell'RNA contiene tutti gli esoni nella trascrizione primaria mentre gli mRNA maturi prodotti dallo splicing alternativo non contengono ogni esone del trascritto dell'RNA primario.

Risultati in

Un'altra differenza tra lo splicing dell'RNA e lo splicing alternativo è il risultato dello splicing. I risultati dello splicing dell'RNA nella molecola dell'mRNA, che può tradursi in una proteina funzionale mentre lo splicing alternativo risulta in diverse varianti dell'mRNA, che possono tradursi in diversi isomeri proteici.

Importanza

La differenza tra lo splicing dell'RNA e lo splicing alternativo basato sulla loro importanza è che lo splicing dell'RNA porta insieme la regione codificante della proteina rimuovendo le regioni non codificanti dalla trascrizione primaria mentre lo splicing alternativo aumenta la diversità informativa e la diversità proteomica della cellula.

Conclusione

Lo splicing dell'RNA è il processo di legatura degli esoni del pre-mRNA eucariotico rimuovendo gli introni. D'altra parte, lo splicing alternativo è la produzione di più mRNA da un singolo pre-mRNA mediante la combinazione differenziale di esoni. La funzione principale dello splicing dell'RNA è produrre un mRNA maturo, che può essere tradotto in una proteina funzionale. Viceversa, lo splicing alternativo produce isomeri proteici con funzionamento differenziale. Pertanto, la principale differenza tra lo splicing dell'RNA e lo splicing alternativo è il loro meccanismo e importanza.

Riferimento:

1. E, Zhiguo et al. "Splicing e splicing alternativo nel riso e nell'uomo" BMB riporta vol. 46,9 (2013): 439-47. Disponibile qui
2. "RNA Splicing." MoBio, pubblicazione di libri Web, disponibile qui
3. Wang, Yan et al. "Meccanismo di splicing alternativo e sua regolazione" Rapporti biomedici vol. 3,2 (2014): 152-158. Disponibile qui

Cortesia dell'immagine:

1. "RNA splicing diagram en" Di LadyofHats - mi sono basato basicamente sulle informazioni trovate in wikipedia plus: [1] e [2]. (Dominio pubblico) via Commons Wikimedia  
2. "RNA splicing reaction" di BCSteve - Opera propria (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia  
3. "Splicing alternativo del DNA" di National Human Genome Research Institute - http://www.genome.gov/Images/EdKit/bio2j_large.gif (Public Domain) via Commons Wikimedia  
4. "RNA Splicing" di OpenStax CNX (CC BY 3.0) tramite OpenStax Collage