Qual è la differenza tra microsatellite e minisatellite

Il differenza principale tra microsatellite e minisatellite è quello l'unità ripetitiva di un microsatellite consiste di 2-6 paia di basi mentre l'unità ripetitiva di un minisatellite consiste di 10-100 coppie di basi. Inoltre, un array microsatellite contiene 5-200 ripetizioni mentre un array minisatellite contiene 10-1.500 ripetizioni.

Microsatellite e minisatellite sono due tipi di DNA ripetitivo nel genoma. L'uso principale del DNA del microsatellite è per scopi di fingerprinting del DNA mentre quello dei minisatelliti è per il test di paternità così come avviene nei gruppi familiari.

Aree chiave coperte

1. Cos'è il Microsatellite
     - Definizione, struttura, importanza
2. Cos'è Minisatellite
     - Definizione, struttura, importanza
3. Quali sono le somiglianze tra microsatellite e minisatellite
     - Profilo delle caratteristiche comuni
4. Qual è la differenza tra microsatellite e minisatellite
     - Confronto tra le principali differenze

Parole chiave

DNA Fingerprinting, microsatellite, minisatellite, test di paternità, DNA ripetitivo

Cos'è il Microsatellite

Un microsatellite è una sequenza ripetitiva di 2-6 paia di basi nel genoma. Poiché si tratta di un tipo di ripetizioni in tandem con brevi sequenze di nucleotidi, i microsatelliti sono anche noti come brevi ripetizioni in tandem (STR). Le ripetizioni di singoli nucleotidi sono chiamate polimorfismo a singolo nucleotide (SNP). Inoltre, i microsatelliti si verificano in tutto il genoma. Nel genoma umano, le ripetizioni dinucleotidiche si verificano ogni 30.000 coppie di basi.

Figura 1: analisi di paternità

Inoltre, i microsatelliti sono una regione altamente mutativa nel genoma. Il metodo principale di acquisizione delle mutazioni è attraverso lo slittamento del DNA durante la replicazione. Sequenze microsatellite uniche si verificano all'interno delle famiglie. Pertanto, utilizziamo l'analisi dei microsatelliti per i test di paternità. Inoltre, l'estensione delle ripetizioni dei microsatelliti del trinucleotide causa gravi disturbi umani come la sindrome dell'X fragile e la malattia di Huntington.

Cos'è un Minisatellite

Minisatellite è una sequenza ripetitiva di 10-100 coppie di basi nel genoma. Qui, l'unità ripetitiva è piuttosto grande e si chiama a Motivo del DNA. Un altro nome per minisatellite è ripetizioni in tandem a numero variabile (VNTRs). Il numero di VNTR è molto variabile tra gli individui. L'unità ripetitiva di un minisatellite è ricca di GC.

Figura 2: Minisatelliti

A causa della natura altamente variabile dei minisatelliti tra gli individui, gli scienziati li usano per l'impronta digitale del DNA. Usano anche i minisatelliti come marcatori genetici durante l'analisi del linkage. Alcune sequenze minisatellite sono coinvolte nella formazione del cancro associato a oncogene ras.

Somiglianze tra microsatellite e minisatellite

• Microsatellite e minisatellite sono due tipi di DNA altamente ripetitivo composto da ripetizioni in tandem nel genoma eucariotico.
• Sebbene non abbiano una funzione assegnata nel genoma, sono importanti per il mantenimento della struttura del genoma.
• Inoltre, queste sequenze di DNA non si verificano nelle regioni intergeniche. Quindi, sono DNA non codificante.
• Inoltre, entrambi possono essere utilizzati nell'identificazione degli individui.
• Alcuni di essi possono essere associati a malattie.
• Appaiono come piccole bande scure nell'analisi del gradiente di densità CsCl.

Differenza tra microsatellite e minisatellite

Definizione

Il microsatellite si riferisce a un insieme di sequenze di DNA ripetute breve in un particolare locus su un cromosoma, che varia in numero in individui diversi e quindi può essere utilizzato per le impronte genetiche mentre il minisatellite si riferisce a una forma di DNA polimorfico, comprendente un numero variabile di ripetizioni in tandem , con unità ripetute fino a circa 100 nucleotidi in lunghezza. Questa è la differenza fondamentale tra microsatellite e minisatellite.

Tipo di ripetizioni in tandem

I microsatelliti sono STR mentre i minisatelliti sono VNTR.

avvenimento

Inoltre, i microsatelliti si verificano principalmente in tutto il genoma mentre i minisatelliti si verificano principalmente alle estremità del genoma.

Dimensione dell'unità ripetitiva

La dimensione dell'unità ripetitiva di un microsatellite è di 2-6 coppie di basi mentre la dimensione dell'unità ripetitiva di un minisatellite è di 10-100 coppie di basi. Questa è una grande differenza tra microsatellite e minisatellite.

Numero di ripetizioni per genoma

Una particolare unità ripetitiva si verifica circa 5-200 volte nel genoma nei microsatelliti mentre una particolare unità ripetitiva si verifica 10-1.500 volte nei minisatelliti.

Dimensione della matrice

Un'altra differenza tra microsatellite e minisatellite è che la dimensione della matrice di unità ripetute è di 10-1000 coppie di basi nei microsatelliti mentre la dimensione della matrice di unità ripetitive è 0,5-15 kb nei microsatelliti. 

Complessità di matrice

La schiera di microsatelliti è principalmente omogenea mentre la matrice dei minisatelliti è eterogenea.

Conclusione

Il microsatellite è un tipo di DNA ripetitivo nel genoma eucariotico con sequenze ripetitive lunghe 2-6 paia di basi. Sono diffusi in tutto il genoma e possono essere utilizzati per i test di paternità. D'altra parte, il minisatellite è un tipo di DNA ripetitivo con 10-100 sequenze ripetute lunghe paia di basi. Si trovano principalmente alla fine dei cromosomi e possono essere utilizzati per il fingerprinting del DNA. Pertanto, la principale differenza tra microsatellite e minisatellite è la loro struttura e importanza.

Riferimento:

1. Ramel, C. "Mini- e Microsatelliti". Prospettive di salute ambientale105.Suppl 4 (1997): 781-789. Disponibile qui

Cortesia dell'immagine:

1. "Stages of Gene Fingerprinting" di Sneptunebear16 - Opera propria (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia  
2. "VNTRexample" di Madelyndotson - Opera propria (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia