Differenza tra Ti e Ri Plasmid

Differenza principale - Ti vs Ri Plasmid

Agrobacterium le specie sono patogeni vegetali che inducono varie malattie nelle piante superiori. I plasmidi Ti (tumore-inducente) e Ri (che induce alla radice) sono due tipi di plasmidi naturali prodotti da Agrobacterium specie. I plasmidi di Ti sono prodotti da Agrobacterium tumefaciens mentre i plasmidi Ri sono prodotti da Agrobacterium rhizogenes. Entrambi i plasmidi Ti e Ri consistono in una parte del DNA plasmidico noto come T-DNA che viene trasferito nel genoma della pianta con l'ausilio dei geni di virulenza (vir). Il differenza principale tra Ti e Ri il plasmidio è quello Ti Plasmid induce tumore / corona di galle nei dicotiledoni mentre Ri plasmide induce radici pelose. A causa della loro capacità di infettare le piante, sia i plasmidi Ti che Ri sono ampiamente utilizzati come vettori per produrre piante transgeniche.

Aree chiave coperte

1. Cos'è Ti Plasmid
     - Definizione, struttura, produzione vettoriale
2. Cos'è Ri Plasmid
     - Definizione, struttura, formazione di vettori
3. Quali sono le somiglianze tra Ti e Ri Plasmid
     - Profilo delle caratteristiche comuni
4. Qual è la differenza tra Ti e Ri Plasmid
    - Confronto tra le principali differenze

Termini chiave: specie di Agrobacterium, ingegneria genetica, radici pelose, Ri Plasmid (PRI), T-DNA, Ti Plasmid (PTI), Tumor, vir Genes

Cos'è Ti Plasmid

Ti plasmide si riferisce a un tipo di plasmide di quello che consente Agrobacterium tumefaciens infettare le piante, producendo un tumore al colon del tumore / corona. Pertanto, il plasmide Ti è costituito sia dalla formazione di tumori che dalla virulenza (vir) geni. Il vir i geni sono responsabili del trasferimento del T-DNA che contiene i geni che formano il tumore nel genoma della pianta mediante escissione e integrazione. Un tipico plasmide Ti è costituito da quattro regioni: regione A (responsabile del T-DNA per la formazione del tumore), regione B (responsabile della replicazione), regione C (responsabile della coniugazione) e regione D (responsabile della virulenza). I geni nella regione del T-DNA controllano la produzione di ormoni della crescita delle piante (auxina e agropina), inducendo la proliferazione delle cellule vegetali infette. Entrambe le estremità della regione del T-DNA sono fiancheggiate da una sequenza di bordo che contiene ripetizioni di sequenza diretta di 24 coppie di basi. Solo il bordo destro è indispensabile per il trasferimento del T-DNA. La struttura del ti plasmide è mostrata in Figura 1.

Figura 1: Ti Plasmid

Nel Agrobacterium-trasformazione mediata dei geni, il vettore è progettato sulla base del ti-plasmide. Il vettore è composto da sequenze di bordo T-DNA, il vir geni e la regione T-DNA modificata. Durante la modifica della regione del T-DNA, i geni responsabili della formazione del tumore vengono rimossi e sostituiti dai geni estranei che devono essere trasformati. 

Cos'è Ri Plasmid

Ri plasmide si riferisce a un tipo di plasmide che consente Agrobacterium rhizogenes infettare le cellule dei pantaloni producendo radici pelose. Consiste di due frammenti di T-DNA conosciuti come Tr-DNA e T1-DNA. Entrambi i frammenti sono separati da un segmento di DNA da 15 kb. Il Tr-DNA è simile alla regione T-DNA del plasmide Ti e contiene geni che inducono la produzione di ormoni della crescita. La regione T1-DNA è composta da quattro geni: rola (responsabile della formazione delle radici pelose), rolB (induce l'iniziazione alla radice e la formazione di callo), ROIC (promuove la crescita delle radici), e Rold (sopprime la crescita del callo). La trasformazione del T-DNA è indotta dal vir geni. La formazione delle radici pelose di Agrobacterium rhizogenes è mostrato in figura 2.

Figura 2: Radici pelose

I plasmidi di Ti sono per lo più sostituiti dai plasmidi Ri nell'ingegneria genetica.

Somiglianze tra Ti e Ri Plasmid

• I plasmidi Ti e Ri sono naturalmente prodotti da Agrobacterium.
• Entrambi i tipi di plasmidi causano malattie in molte piante dicotiledoni.
• Entrambi i plasmidi Ti e Ri trasferiscono una parte del DNA plasmidico noto come T DNA nel genoma della pianta con l'aiuto dei geni di virulenza (vir).
• La dimensione di entrambi i plasmidi Ti e Ri è di circa 200 kb.
• Le sequenze regolatrici di alcuni geni presenti nel T DNA di entrambi i plasmidi sono riconosciute dai meccanismi cellulari della pianta.
• Gli altri geni nel DNA T sono costituiti da sequenze regolatorie procariotiche.
• A causa della capacità di infettare le cellule vegetali, sia i plasmidi Ti che Ri sono utilizzati nell'ingegneria genetica per produrre piante transgeniche.

Differenza tra Ti e Ri Plasmid

Definizione

Ti Plasmid: Ti plasmide è un tipo di plasmide che consente ai batteri di infettare le piante, producendo un tumore al colon del tumore / corona.

Ri Plasmid: Ri plasmid è un tipo di plasmide che consente ai batteri di infettare le cellule vegetali producendo radici pelose.

Tipo di Agrobacterium specie

Ti Plasmid: Ti plasmide è prodotto da Agrobacterium tumefaciens.

Ri Plasmid: Ri plasmid è prodotto da Agrobacterium rhizogenes.

Taglia

Ti Plasmid: La dimensione del plasmide Ti è di 180-205 kb.

Ri Plasmid: La dimensione del plasmide Ri è 250 kb.

Tipo di malattia

Ti Plasmid: Ti plasmide induce la formazione di gallo corona / tumore.

Ri Plasmid: Il plasmidio Ri induce la formazione di radici pelose.

Tipo di studio

Ti Plasmid: I plasmidi di Ti sono meno studiati rispetto ai plasmidi di Ri.

Ri Plasmid: I plasmidi Ri sono ben studiati.

Conclusione

Ti plasmide e Ri plasmide sono due tipi di plasmidi trovati in differenti Agrobacterium specie. Entrambi i plasmidi Ti e i plasmidi Ri sono costituiti da T-DNA e vir geni. Ti possono essere trovati plasmidi Agrobacterium tumefaciens che induce la formazione del tumore al galoppo coronarico. Ri plasmidi possono essere trovati in Agrobacterium rhizogenes che induce la formazione di radici pelose. La principale differenza tra Ti e Ri plasmide è il tipo di malattia causata da ciascun tipo di plasmidi.

Riferimento:

1. "Lecture 26: Ti e Ri Plasmids." NPTEL, IIT Guwahati, disponibile qui.
2. Mangia, Deena T Kochunni Jazir. "Agrobacterium rhizhogenes e Ri Plasmid." Disponibile qui.

Cortesia dell'immagine:

 1. "Ti plasmid" di Mouagip - Opera propria (CC0) tramite Commons Wikimedia
2. "Agrobacterium rhizogenes" di FruitDefendu - Opera propria (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia