Differenza tra il modello e il codice

Main Difference - Template vs Coding Strand

Il filamento di template e coding sono i due termini che descrivono i due filamenti nel DNA a doppio filamento. Durante la trascrizione, uno dei due filamenti del DNA a doppio filamento funge da filamento modello. Il modello strand viene eseguito in direzione 3 'a 5'. L'altro filamento nel DNA a doppio filamento, che va dalla direzione 5 'a 3' è noto come il filo codificatore. Il filamento di stampo è responsabile della sequenza di amminoacidi nel sintetizzare la catena polipeptidica. Il differenza principale tra il modello e il filo di codifica è quello template strand funge solo da modello per la trascrizione considerando che la codifica del filamento contiene la stessa esatta sequenza di nucleotidi nell'mRNA eccetto la timina.

Questo articolo guarda,

1. Cos'è Template Strand
     - Definizione, caratteristiche, struttura
2. Cosa è Coding Strand
     - Definizione, caratteristiche, struttura
3. Qual è la differenza tra Template e Coding Strand

Cos'è Template Strand

Il filamento del modello è il filo che funge da modello per la sintesi dell'mRNA durante la trascrizione. Di solito, l'RNA polimerasi, che è l'enzima coinvolto nella trascrizione dei geni in mRNA, aggiunge nucleotidi nella direzione da 5 'a 3' al filamento crescente di mRNA. Pertanto, il filo modello dovrebbe essere diretto da 3 'a 5' per aggiungere nucleotidi complementari al filamento di mRNA in crescita nella direzione da 5 'a 3'. Quindi, il filamento di DNA, che consiste nella direzionalità da 3 'a 5' nel DNA a doppio filamento, può fungere da modello per la trascrizione. Ciò significa che il filamento di stampo è il filamento di DNA nel DNA a doppia elica che è responsabile della sequenza di amminoacidi della catena polinucleotidica sintetizzata. L'altro filamento di DNA nel DNA a doppio filamento è chiamato non-modello. Il filo modello è anche chiamato il filo antisenso o il filo positivo.

Il filo modello è costituito da una sequenza di anti-codoni che sono le triplette nucleotidiche trovate nei tRNA individualmente. L'anti-codone è complementare ai codoni nel non-modello o nel filo codificante. L'mRNA sintetizzante viene temporaneamente attaccato al filamento della maschera formando legami idrogeno con i nucleotidi complementari nel filamento del modello. La RNA polimerasi aggiunge uracile come nucleotide complementare al filamento di mRNA per adenina nel filamento modello invece di timina. Il modello di filo nella trascrizione è mostrato in Figura 1.

Figura 1: modello Strand

Cosa è Coding Strand

Il filamento di DNA che funge da filamento non-modello durante la trascrizione viene indicato come il filo codificante. La trascrizione è allungata nella direzione da 5 'a 3' aggiungendo nucleotidi complementari al filamento dell'mRNA. Anche il filo di codifica va dalla direzione 5 'a 3'. Quindi, la codifica del filo è incapace di servire come modello durante la trascrizione. Il filamento codificante contiene codoni, che sono le triplette nucleotidiche che specificano un amminoacido unico nella catena polipeptidica. Questi codoni costituiscono collettivamente il codice genetico, che è una caratteristica universale in quasi tutte le forme viventi sulla terra. La codifica del filo durante la trascrizione è mostrata in figura 2.

Figura 2: codice di codifica nella trascrizione

Il filamento codificante contiene la stessa sequenza nucleotidica del trascritto primario dell'mRNA. Pertanto, strumenti bioinformatici come GLIMMER e GeneMark, che sono coinvolti nel reperimento di geni in una particolare sequenza di DNA, dipendono dalla sequenza codificante al fine di predire i geni in quella particolare sequenza di DNA. Poiché il filamento di codifica contiene sequenze simili all'mRNA, le sequenze uniche nel codone di inizio simile a mRNA, nel codone di stop e nel frame di lettura aperto possono essere trovate nella sequenza di codifica. Queste caratteristiche, insieme alle sequenze del promotore, possono essere utilizzate da strumenti di bioinformatica per predire i geni di Dall'inizio metodo.

Differenza tra il modello e il codice

nomi

Modello Strand: Il filo del modello è anche conosciuto come filamento antisenso, filamento non codificante o filamento negativo.

Coding Strand: Il filamento di codifica è anche noto come filamento di senso, filo non sagomato o filamento positivo.

Direzione

Modello Strand: Il filo del modello è diretto nella direzione da 5 'a 3'.

Coding Strand: Il filo di codifica è diretto nella direzione da 3 'a 5'.

Trascrizione

Modello Strand: Il filo del modello è trascritto in mRNA.

Coding Strand: La codifica del filo non viene trascritta nell'mRNA.

Messenger RNA

Modello Strand: Il filamento di modello contiene la sequenza nucleotidica complementare come l'mRNA.

Coding Strand: Il filamento di codifica contiene la stessa sequenza nucleotidica per l'mRNA, eccetto la timina.

Codone / Anticodone

Modello Strand: Il filo del modello contiene anti-codoni.

Coding Strand: Il codice in codice contiene i codoni.

Legame idrogeno

Modello Strand: I legami idrogeno si formano tra il filamento della maschera e l'mRNA sintetizzante, temporaneamente durante la trascrizione.

Coding Strand: Non si formano legami idrogeno tra il filamento codificante e l'mRNA sintetizzato durante la trascrizione.

Trasferire l'RNA

Modello Strand: Il filamento di modello contiene la stessa sequenza nucleotidica del tRNA. 

Coding Strand: Il filamento di codifica contiene la sequenza nucleotidica complementare come tRNA.

Conclusione

La molecola di DNA a doppio filamento è composta da due filamenti di DNA, che sono chiamati filo di modello e filo di codifica. Il modello strand serve come modello di DNA per la trascrizione, che è il primo passo dell'espressione genica. La RNA polimerasi aggiunge nucleotidi complementari ai nucleotidi che sono codificati nel filamento del modello per formare il trascritto di RNA primario. L'aggiunta di nucleotidi avviene nella direzione da 5 'a 3'. Quindi, la direzionalità del modello dovrebbe essere da 3 'a 5'. Il filamento di DNA non-template, che corre nella direzione da 5 'a 3', viene chiamato filo di codifica poiché contiene la stessa sequenza nucleotidica nel filamento dell'mRNA. Pertanto, la principale differenza tra il modello e il filamento di codifica è la loro capacità di essere trascritti da RNA polimerasi.

Riferimento:
1. Alberts, Bruce. "Dal DNA all'RNA." Biologia molecolare della cellula. 4a edizione. U.S. National Library of Medicine, 01 gennaio 1970. Web. 23 marzo 2017.
2. "Senso (biologia molecolare)." Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22 marzo 2017. Web. 23 marzo 2017.

Cortesia dell'immagine:
1. "0324 DNA Translation and Codons" di OpenStax - (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia
2. "Semplice trascrizione allungamento1" di Forluvoft - Opera propria (di dominio pubblico) tramite Commons Wikimedia