Differenza tra snRNA e snoRNA

Differenza principale - snRNA vs snoRNA

snRNA e snoRNA sono due tipi di piccole molecole di RNA non codificanti che si trovano nella cellula. Sia lo snRNA che lo snoRNA sono coinvolti nella modifica dell'RNA subito dopo la trascrizione. Lo snRNA si trova nello splicing delle maculature e nei corpi di Cajal del nucleo della cellula. L'adattatore fosforilato per l'esportazione nucleare (PHAX) è coinvolto nel trasporto di snRNA e snoRNA nel sito di azione nel nucleo. Il differenza principale tra snRNA e snoRNA è quello snRNA è coinvolto nello splicing alternativo di molecole pre-mRNA per determinare quale sequenza deve essere tradotta in una proteina, mentre snoRNA è coinvolto nella modifica di rRNA e tRNA, editing di mRNA e imprinting genomico.

Aree chiave coperte

1. Cos'è lo snRNA
      - Definizione, Caratteristiche, Funzione
2. Cos'è lo snoRNA
      - Definizione, Caratteristiche, Funzione
3. Quali sono le somiglianze tra snRNA e snoRNA
      - Profilo delle caratteristiche comuni
4. Qual è la differenza tra snRNA e snoRNA
      - Confronto tra le principali differenze

Termini chiave: splicing alternativo, impronta genomica, rRNA modificante, redazione di mRNA, RNA nucleare piccolo (snRNA), RNA nucleico piccolo (snoRNA), U-RNA

Cos'è lo snRNA

Piccolo RNA nucleare (snRNA) è un tipo di piccolo RNA non codificante, comprendente da 80 a 350 nucleotidi nelle molecole. Viene anche chiamato lo snRNA U-RNA e possono essere trovati in splicing speckles e corpi di Cajal del nucleo. Lo snRNA è un componente delle piccole ribonucleoproteine ​​nucleari (snRNPs), che forma lo spliceosoma che controlla lo splicing delle molecole pre-mRNA durante le modificazioni post-trascrizionali. Il pre-mRNA eucariotico consiste sia di introni che di esoni. Gli introni dovrebbero essere rimossi dalla sequenza legando insieme gli esoni.

Figura 1: RNA Splicing

Lo splicing alternativo negli eucarioti produce diverse sequenze di mRNA, formando diversi tipi di proteine. Uno spliceosoma contiene circa 145 proteine. Queste proteine ​​svolgono un ruolo nell'espressione genica piuttosto che nello splicing. I cinque tipi di snRNP coinvolti nello splicing sono U1, U2, U4, U5 e U6. U2 e U6 iniziano lo splicing. La rimozione degli introni dalle molecole pre-mRNA è ottenuta sulla base di tre sequenze. Sono un sito di splicing da 5 ', un punto di diramazione e un sito di splicing da 3'. In genere, gli introni iniziano con una GT e terminano con un AT. Lo splicing alternativo è ottenuto dall'accoppiamento di base complementare di un sito GT con il sito AT di un altro introne. Circa il 15% delle mutazioni a punto singolo nel pre-mRNA possono influenzare il processo di splicing. Lo splicing dell'RNA è mostrato in Figura 1. 

Cos'è lo snoRNA

Piccolo RNA nucleolare (snoRNA) è l'altro tipo di piccolo RNA non codificante che è coinvolto nella modifica e nell'elaborazione dei precursori di rRNA e tRNA. La funzione principale dello snoRNA è la maturazione dell'rRNA durante la formazione del ribosoma. Lo snoRNA è coinvolto anche nell'editing di mRNA e nell'imprinting del genoma. Lo snoRNA può avere da 80 a 1000 nucleotidi in lunghezza nel lievito.

Figura 2: Struttura secondaria dello snoRNA della scatola C / D

Due tipi di snoRNA possono essere identificati sulla base degli elementi di sequenza distinti ed evolutivamente conservati presenti in ciascuno snoRNA. Sono gli snoRNA della scatola C / D e della scatola H / ACA. La scatola C / D è coinvolta nella 2-O-metilazione e la scatola H / ACA è coinvolta nella pseudo-uridilazione. Alcuni degli snoRNA sono onnipresenti, alcuni sono specifici dei tessuti e gli altri sono stampati. La struttura secondaria della scatola C / D snoRNA è mostrata in figura 2. 

Somiglianze tra snRNA e snoRNA

• snRNA e snoRNA sono tipi di piccoli RNA non codificanti nella cellula.
• Sia lo snRNA che lo snoRNA sono coinvolti nella modifica dell'RNA all'interno del nucleo.
• L'adattatore fosforilato per l'esportazione nucleare (PHAX) è coinvolto nel trasporto di ciascun snRNA e snoRNA nel sito di azione nel nucleo.

Differenza tra snRNA e snoRNA

Definizione

snRNA: snRNA è una classe di piccoli RNA trovati nel nucleo degli eucarioti, coinvolti nell'elaborazione del pre-mRNA.

snoRNA: snoRNA è un tipo di piccolo RNA, che guida le modificazioni chimiche di rRNA e altri RNA come tRNA e snRNA.

Sta per

snRNA: snRNA sta per piccolo RNA nucleare.

snoRNA: snoRNA sta per piccolo RNA nucleolare.

Trovato in

snRNA: SnRNA si trova solo negli eucarioti.

snoRNA: lo snoRNA può essere trovato sia negli eucarioti che negli archei.

Taglia

snRNA: La molecola di snRNA è lunga da 80 a 350 nucleotidi.

snoRNA: Lo snoRNA è da 80 a 1000 nucleotidi di lunghezza nel lievito.

Funzione

snRNA: siRNA è coinvolto nello splicing alternativo negli eucarioti.

snoRNA: snoRNA è coinvolto nell'editing di mRNA, nella modifica di rRNA e tRNA e nell'imprinting del genoma.

Conclusione

snRNA e snoRNA sono due tipi di piccoli RNA non codificanti coinvolti nell'elaborazione dell'RNA precursore. Lo snRNA è coinvolto nello splicing dell'mRNA eucariotico durante le modificazioni post-trascrizionali. Lo snoRNA è coinvolto nella maturazione di rRNA e tRNA. Pertanto, la principale differenza tra snRNA e snoRNA è la loro funzione nell'elaborazione dell'RNA precursore.

Riferimento:

1. "SnRNAs sono richiesti per lo splicing." CELLS. N., n. Web. Disponibile qui. 24 luglio 2017. 
2. "SnoRNA eucariotici: un paradigma per la flessibilità dell'espressione genica." ScienceDirect. N., n. Web. Disponibile qui. 24 luglio 2017. 
3. "MOLECOLE DI RNA PIÙ FUNZIONALI". GENETICA. N., n. Web. Disponibile qui. 24 luglio 2017. 

Cortesia dell'immagine:

1. "RNA splicing diagram en" di LadyofHats (di dominio pubblico) tramite Commons Wikimedia
2. "RF00071" - prelevato dal database Rfam (dominio pubblico) tramite Commons Wikimedia