Differenza tra sgRNA e gRNA

sgRNA è l'RNA a guida singola, un termine usato per descrivere gRNA, mentre gRNA è l'RNA guidato, una molecola di RNA usata per specificare un particolare bersaglio per le endonucleasi nell'editing del genoma basato sul sistema CRISPR. Perciò, sia lo sgRNA che il gRNA sono termini intercambiabili usati per descrivere la stessa molecola. Non c'è molta differenza tra sgRNA e gRNA.

Sia lo sgRNA che il gRNA sono molecole sintetiche e assomigliano al crRNA nel sistema CRISPR per funzione. 

Aree chiave coperte

1. Cos'è lo sgRNA
     - Definizione, significato
2. Cos'è gRNA
     - Definizione, struttura, funzione
3. Quali sono le somiglianze tra sgRNA e gRNA
     - Profilo delle caratteristiche comuni
4. Qual è la differenza tra sgRNA e gRNA
     - Confronto tra le principali differenze

Parole chiave

Cas, Genome editing basato su CRISPR, gRNA, sgRNA, Spacer Sequence 

Cos'è lo sgRNA 

sgRNA (RNA a guida singola) è un altro termine usato per descrivere gRNA. 

Figura 1: sgRNA

Cos'è gRNA 

gRNA (guida RNA) è una breve molecola di RNA sintetica utilizzata nell'editing del genoma basato sul sistema CRISPR, uno dei tipi altamente specifici di strumento di modifica del genoma. gRNA consiste in una sequenza nucleotidica di circa 20 bp che si lega a una sequenza di DNA bersaglio del genoma. Questa sequenza è chiamata il sequenza spaziale. La molecola di gRNA è composta da una sequenza di scaffold per il legame di Cas, l'endonucleasi. Quindi, i due componenti del genoma basato su CRISPR sono il gRNA e l'endonucleasi associata a CRISPR (Cas). D'altra parte, il bersaglio del genoma del sistema CRISPR si altera con la sequenza del gRNA. 

Figura 2: Ruolo gRNA nell'editing genomico

Esistono tre tipi di gRNA basati sul metodo di sintesi. Sono il crrNA sintetico, lo sgRNA lentivirale e lo sgRNA sintetico.  

Somiglianze tra sgRNA e gRNA 

• sgRNA e gRNA sono piccole molecole di RNA utilizzate per specificare la sequenza target per le endonucleasi negli strumenti di modifica del genoma basati sul sistema CRISPR. 
• Entrambi hanno una regione di 20 bp che si ibrida con il DNA. 
• Entrambe sono molecole artificiali e non si verificano in natura. 
• Entrambi svolgono la stessa funzione, cioè la funzione crRNA funziona nel sistema CRISPR naturale. 

Differenza tra sgRNA e gRNA 

Definizione 

sgRNA (RNA a guida singola) si riferisce al gRNA utilizzato nel sistema CRISPR artificiale mentre gRNA (RNA guida) si riferisce alle sequenze brevi e sintetiche dell'RNA che specificano la sequenza target per l'editing del genoma basato su CRISPR. 

• Sia lo sgRNA che il gRNA sono termini intercambiabili usati per descrivere la stessa molecola

Conclusione 

sgRNA è un altro termine per gRNA mentre gRNA sono le sequenze brevi e sintetiche dell'RNA utilizzate per specificare la sequenza bersaglio nel genoma per l'endonucleasi nel sistema CRISPR. Sia lo sgRNA che il gRNA sono uno dei componenti dell'editing del genoma basato su CRISPR. Pertanto, la principale differenza tra sgRNA e gRNA è solo la terminologia. 

Riferimento:

1. "Guida CRISPR." Addgene: guida CRISPR, Disponibile qui

Cortesia dell'immagine:

1. "15 Hegasy Cas9 DNA Tool Wiki E CCBYSA" Di Guido4 - Opera propria (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 
2. "CRISPR-Cas9-biologist" di J LEVIN W - Opera propria (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia