Differenza tra Marker selezionabile e Gene Reporter

Il differenza principale tra il marcatore selezionabile e il gene reporter è che il un marcatore selezionabile è usato per distinguere tra trasformanti e non trasformanti mentre il gene reporter è usato per misurare il livello di espressione del gene trasformato. Inoltre, il gene marcatore selezionabile ha il suo promotore mentre l'espressione del gene reporter è regolata dal promotore del gene trasformato.

Il gene selezionatore e reporter selezionabile sono due tipi di geni utilizzati per analizzare i trasformanti negli studi che producono organismi transgenici.

Aree chiave coperte

1. Che cosa è un marcatore selezionabile
     - Definizione, scopo, esempi
2. Che cos'è un reporter Gene
     - Definizione, scopo, esempi
3. Quali sono le somiglianze tra il marcatore selezionabile e il gene reporter
     - Profilo delle caratteristiche comuni
4. Qual è la differenza tra Marker selezionabile e Gene Reporter
     - Confronto tra le principali differenze

Parole chiave

Analisi dell'espressione genica, gene di interesse, gene del reporter, marcatore selezionabile, trasformanti

Che cosa è un marcatore selezionabile

Il marcatore selezionabile è un tipo di geni marcatori generalmente localizzati nel plasmide. Si trasforma nella cellula ospite con l'aiuto del plasmide. I trasformanti che contengono il marcatore selezionabile possono crescere nel corrispondente terreno selezionabile. Ma i non trasformanti, che mancano del marcatore selezionabile, non possono crescere in quel mezzo selezionabile. Ciò significa che il prodotto genico del marcatore selezionabile diventa il fattore di selezione per la sopravvivenza.

I tre gruppi di marcatori selezionabili sono geni di resistenza agli antibiotici, geni marcatori di antimetaboliti e geni di resistenza agli erbicidi. I marcatori selezionabili più ampiamente utilizzati sono i geni di resistenza agli antibiotici. Quindi, solo i trasformanti possono crescere nel mezzo, che contiene l'antibiotico corrispondente.

Marker selezionabile 

Figura 1: Ruolo dei geni resistenti agli antibiotici nella clonazione molecolare

Tuttavia, tutti i trasformanti non possono contenere il gene di interesse. Alcuni trasformanti possono avere solo il vettore con il marcatore selezionabile. L'analisi del sequenziamento o dell'espressione genica consente solo l'individuazione di ricombinanti che hanno il gene di interesse.

Che cos'è un reporter Gene

Il gene reporter è un tipo di geni marker utilizzati per quantificare l'espressione genica. Sono fusi alla sequenza regolativa del gene di interesse. Oltre all'analisi dell'espressione del gene di interesse, i geni reporter consentono di studiare la funzione degli elementi regolatori del gene e l'effetto dei fattori di trascrizione sull'espressione genica. Inoltre, i geni reporter sono vitali per l'identificazione dell'espressione genica specifica del tessuto o del pathway.

Figura 2: ruolo del gene reporter

La proteina fluorescente verde (GFP) e la luciferasi sono il tipo più comune di geni reporter. GFP è una proteina luminosa a luce UV. La presenza di altre proteine ​​fluorescenti come le proteine ​​fluorescenti rosse e gialle consente l'identificazione di diverse proteine ​​nello stesso sistema. La luciferasi è un enzima che catalizza la produzione di luce giallo-verde o blu dal substrato luciferina.

Somiglianze tra marcatore selezionabile e gene reporter

• Il marcatore e il gene reporter selezionabili sono due tipi di geni marker utilizzati per analizzare i trasformanti.
• Vengono trasformati nell'organismo ospite insieme al gene di interesse.
• Entrambi i tipi di geni reporter non sono presenti nella cellula ospite in condizioni normali. Quindi, sono estranei alla cellula ospite.

Differenza tra il marcatore selezionabile e il gene del referto

Definizione

Il marcatore selezionabile si riferisce a un gene la cui espressione consente di identificare cellule che sono state trasformate o trasfettate con un vettore contenente il gene marcatore mentre il gene reporter si riferisce a un gene usato per "etichettare" un altro gene o sequenza di DNA di interesse, come un promotore.

Importanza

Il marcatore selezionabile aiuta a distinguere tra trasformanti e non trasformanti, mentre il gene reporter aiuta a misurare la quantità di espressione del gene trasformato.

Promotore

Il marcatore selezionabile ha il suo promotore mentre il gene reporter è regolato sotto il promotore del gene trasformato.

Posizione

Il creatore selezionabile può essere nel plasmide o all'interno del costrutto genico mentre il gene reporter si trova tra il promotore e il gene di interesse.

Risultato

Le cellule trasformate con il creatore selezionabile possono crescere nel mezzo selezionabile ma il non trasformante non può crescere poiché manca il marker selezionabile mentre la quantità di prodotto genico nel gene reporter dipende dalla quantità di geni di interesse trasformati..

Esempi

Geni di resistenza agli antibiotici, geni marcatori di antimetaboliti e geni di resistenza agli erbicidi sono i tipi di marcatori selezionabili mentre GFP e Luciferasi sono alcuni geni reporter.

Conclusione

I marcatori selezionabili sono i geni marcatori utilizzati per schermare i trasformanti nel corrispondente terreno selezionabile mentre i geni reporter sono geni marcatori per misurare la quantità di espressione. La principale differenza tra marcatori selezionabili e geni reporter è il tipo di screening.

Riferimento:

1. Jha, Nandkishor. "Geni marcatori selezionabili e geni reporter". Discussione sulla biologia, 16 ottobre 2015, disponibile qui
2. "Analisi del gene del reporter". Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, disponibile qui

Cortesia dell'immagine:

1. "Steps of Molecular Cloning" di Alexpicardal97 - Opera propria (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 
2. "Reporter gene" di TransControl su en.wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia