Differenza tra DNA ripetitivo e DNA satellite

Differenza principale - DNA ripetitivo vs DNA satellite

DNA ripetitivo e DNA satellitare sono due tipi di DNA trovati nel genoma della maggior parte degli eucarioti. Il differenza principale tra DNA ripetitivo e DNA satellitare è quello Il DNA ripetitivo è una piccola sequenza di DNA che viene ripetuta centinaia o migliaia di volte mentre il DNA satellite è sequenze di DNA altamente ripetitive, costituendo una parte considerevole del genoma. I due tipi di ripetizioni trovate nel genoma sono ripetizioni in tandem e ripetizioni intervallate. Il DNA satellite consiste in molte ripetizioni in tandem di una breve unità di ripetizione di base. Si trova su specifici cromosomi del genoma umano e vicino ai centromeri dei cromosomi.

Aree chiave coperte

1. Cos'è il DNA ripetitivo
     - Definizione, grassi, tipi
2. Cos'è il DNA satellitare
     - Definizione, fatti, tipi
3. Quali sono le somiglianze tra DNA ripetitivo e DNA satellite
     - Profilo delle caratteristiche comuni
4. Qual è la differenza tra DNA ripetitivo e DNA satellite
     - Confronto tra le principali differenze

Termini chiave: ripetizioni intercalari, microsatelliti, minisatelliti, DNA ripetitivo, DNA satellite, ripetizioni tandem

Cos'è il DNA ripetitivo

Il DNA ripetitivo si riferisce agli stiramenti del DNA che si ripetono in tutto il genoma. Rappresenta una parte del DNA non codificante diffuso attraverso l'eucromatina. L'unità ripetitiva può consistere di poche coppie di basi in centinaia di coppie di basi. La dimensione media dell'unità ripetitiva è di 300 bp. Può essere ripetuto per 10-10⁵ copie per genoma. I due tipi principali di DNA ripetitivo sono ripetizioni in tandem e ripetizioni intervallate. Le ripetizioni in tandem sono mostrate in Figura 1.

Figura 1: ripetizioni in tandem

Nelle ripetizioni in tandem, le copie di un'unità di sequenza ripetitiva si trovano adiacenti l'una all'altra, formando un blocco o una matrice. Satellite DNA è un tipo di ripetizioni in tandem. Nelle ripetizioni intervallate, le sequenze ripetitive sono disperse nel genoma come singole unità affiancate da una sequenza unica. Gli elementi trasponibili come i trasposoni del DNA e i retrotrasposoni sono ripetizioni intervallate.

Cos'è il DNA satellitare

Il DNA satellite si riferisce a sequenze di DNA brevi e ripetitive spesso presenti nelle regioni centromeriche del genoma. Sono le principali unità funzionali del centromero. Il DNA satellite si trova anche nell'eterocromatina come costituente strutturale principale. Nel genoma umano, il DNA satellite può essere trovato nei cromosomi 1, 9 e 16 e nei bracci corti dei cromosomi 13-15, 21 e 22. Il DNA satellite è un tipo di ripetizioni in tandem. È composto da brevi sequenze nucleotidiche intorno a 60 bp che si ripetono più di 10⁶ volte nel genoma. I due principali tipi di DNA satellite sono minisatelliti e microsatelliti. Viene mostrata una sequenza minisatellite figura 2.

Figura 2: DNA minisatellite

I minisatelliti consistono di 10-60 paia di basi nell'unità ripetitiva. Si trovano in molti punti del genoma compresi i centromeri. I microsatelliti consistono di meno di 10 paia di basi nell'unità ripetitiva e si trovano principalmente nei telomeri.

Somiglianze tra DNA ripetitivo e DNA satellite

• DNA ripetitivo e DNA satellite sono due tipi di DNA trovati nel genoma eucariotico.
• Sia il DNA ripetitivo che il DNA satellite consistono in unità di sequenza ripetute.
• Sia il DNA ripetitivo che il DNA satellite sono tipi di DNA non codificante.
• Sia il DNA ripetitivo che il DNA satellite non codificano per le proteine.
• Sia il DNA ripetitivo che il DNA satellite si trovano nelle regioni intergeniche.
• Sia il DNA ripetitivo che il DNA satellite sono importanti per il mantenimento della struttura del genoma.

Differenza tra DNA ripetitivo e DNA satellite

Definizione

DNA ripetitivo: Il DNA ripetitivo si riferisce agli stiramenti del DNA che si ripetono in tutto il genoma.

DNA satellitare: Il DNA satellite si riferisce alle brevi sequenze di DNA ripetute che si trovano spesso nelle regioni centromeriche del genoma.

Tipi di sequenze ripetitive

DNA ripetitivo: Il DNA ripetitivo è costituito da ripetizioni in tandem o ripetizioni intervallate.

DNA satellitare: Il DNA satellite consiste in ripetizioni in tandem.

Dimensione dell'unità ripetitiva

DNA ripetitivo: Il DNA ripetitivo può consistere di poche coppie di basi in centinaia di coppie di basi nell'unità ripetitiva.

DNA satellitare: Il DNA satellite consiste di unità ripetitive corte (fino a 60 paia di basi lunghe). 

Grado di ripetizione

DNA ripetitivo: Il DNA ripetitivo è sequenze moderatamente ripetitive (10-10⁵ ripetizioni per genoma).

DNA satellitare: Il DNA satellite consiste in sequenze altamente ripetitive (> 10⁶ ripetizioni per genoma).

Situato in

DNA ripetitivo: Il DNA ripetitivo si trova nelle regioni intergeniche del genoma.

DNA satellitare: Il DNA satellite si trova su specifici cromosomi e centromeri dei cromosomi.

tipi

DNA ripetitivo: I due tipi principali di DNA ripetitivo sono ripetizioni in tandem e ripetizioni intervallate.

DNA satellitare: I due principali tipi di DNA satellite sono microsatelliti e minisatelliti.

Ruolo

DNA ripetitivo: Il DNA ripetitivo funge da dispositivo evolutivo, catalizzando la formazione di nuovi geni.

DNA satellitare: Il DNA satellitare ha un ruolo importante nel fingerprinting del DNA.

Nell'analisi del gradiente di densità CsCl

DNA ripetitivo: Il DNA ripetitivo appare come bande di luce.

DNA satellitare: Il DNA satellite appare come piccole bande scure.

Conclusione

DNA ripetitivo e DNA satellite sono due tipi di ripetizioni del DNA trovate nel genoma. Il DNA ripetitivo è sequenze di DNA moderatamente ripetute mentre il DNA satellite è sequenze di DNA brevi e ripetute. La principale differenza tra DNA ripetitivo e satellite è il grado di ripetizione.

Riferimento:

1. López-Flores, I. e M.A. Garrido-Ramos. "Il contenuto ripetitivo di DNA dei genomi eucariotici". Karger Publishers, 25 giugno 2012, disponibile qui.
2.Garrido-Ramos, Manuel A. "DNA satellitare: un argomento in evoluzione." Genes, MDPI, settembre 2017, disponibile qui.

Cortesia dell'immagine:

1. "VNTR2individuals5or7repeats" di Madelyndotson - Opera propria (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia