Differenza tra procariotica ed Eukaryotic RNA Polymerase

Differenza chiave - RNA polimerasi procariotica vs eucariotica

L'RNA polimerasi è l'enzima responsabile del processo di trascrizione che ha luogo in tutti gli organismi viventi. L'RNA polimerasi è un enzima ad alto peso molecolare. Il nome ufficiale di RNA polimerasi è il RNA polimerasi diretta dal DNA. Durante la trascrizione, l'RNA polimerasi apre il DNA a doppio filamento in modo che un filamento di DNA possa essere usato come modello per il processo di sintesi di una molecola di mRNA. Generazione di RNA (mRNA, rRNA e tRNA) Le molecole sono un passo estremamente importante nella sintesi proteica (traduzione). Fattori di trascrizione e complessi mediati dalla trascrizione stanno guidando l'enzima RNA polimerasi per iniziare la trascrizione in una cellula vivente. La RNA polimerasi si attacca alla regione del promotore del gene (DNA) e avvia la trascrizione catalizzata da RNA polimerasi. La trascrizione procariotica ed eucariotica differisce principalmente a causa della differenza nell'enzima RNA polimerasi. Il differenza fondamentale tra Procariotica ed Eukaryotic RNA Polymerase è quello la trascrizione procariotica è eseguita da un singolo tipo di subunità multi RNA polimerasi. Al contrario, la trascrizione eucariotica è catalizzata da tre diversi tipi di RNA polimerasi denominate RNA polimerasi I(trascrivere rRNA), RNA polimerasi II (trascrivere mRNA) e RNA polimerasiIII (trascrivere tRNA).

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è la RNA polimerasi procariotica
3. Cos'è la RNA polimerasi eucariotica
4. Somiglianze tra procariotica ed eucariotica RNA polimerasi
5. Confronto affiancato - Procariotico vs RNA polimerasi eucariotica in forma tabulare
6. Sommario

Cos'è la RNA polimerasi procariotica?

L'RNA polimerasi procariota è un enzima pesante multisubunità. La RNA polimerasi di E coli è ampiamente studiato. Questo è un enzima complesso che ha un peso molecolare di 450 KDa. L'oloenzima è costituito da due componenti principali. Sono i principali enzimi e fattori di trascrizione. Il componente enzimatico nucleo ha cinque subunità come β ', β, αI, αII e ω. I fattori di trascrizione sono sigma factor (initiation), nusA (allungamento).

Di questi fattori, il β 'ha la funzione di legare il DNA. E il fattore β ha il sito catalitico che svolge la polimerizzazione dell'RNA. Le funzioni dei fattori α e ω non sono ancora state scoperte. Alcuni dicono che il fattore alfa (α) è responsabile dell'iniziazione e dell'interazione della catena con le proteine regolatrici. La funzione principale del fattore sigma è il riconoscimento del promotore. Una volta che il promotore nel DNA è riconosciuto dal fattore sigma, il componente del coenzima della polimerasi dell'RNA si lega con la regione del promotore e inizia la polimerizzazione dell'RNA. Una volta iniziata la trascrizione, il fattore sigma viene rilasciato dal DNA. L'allungamento della molecola di RNA è fatto dalla subunità β. Nella terminazione della catena, il "fattore rho" rilascia la molecola di RNA già trascritta.

Figura 01: la polimerasi dell'RNA procariotico

La trascrizione termina nei siti specificati dal modello DNA. Il fattore nusA è coinvolto nella funzione dell'allungamento e della terminazione della catena. L'antibiotico rifampicina può legarsi alla subunità beta della RNA polimerasi batterica. In tal modo, impedisce all'enzima di iniziare la polimerizzazione dell'RNA batterico. Un altro antibiotico noto come streptolydigin inibisce il processo di allungamento della polimerizzazione dell'RNA batterico. I procarioti mRNA è policistronico, nel senso che contiene codoni di più di un cistrone (più di un gene).

Cos'è la RNA polimerasi eucariotica?

Le RNA polimerasi eucariotiche sono tre diversi tipi. Trascrivono diverse classi di geni. E funziona anche in condizioni diverse. I fattori di inizio e di termine (fattori sigma e rho) sono completamente diversi dalle controparti di RNA polimerasi procariote. Le tre diverse RNA polimerasi sono denominate come, RNA polimerasi I (trascrive rRNA), RNA polimerasi II (trascrive mRNA) e RNA polimerasi III (trascrizione di tRNA). L'RNA polimerasi I si trova nel nucleolo e l'enzima richiede Mg²⁺ per la sua attività. L'RNA polimerasi II si trova nel nucleoplasma e ha bisogno di ATP per la sua attività. L'RNA polimerasi III si trova anche nel nucleoplasma.

I promotori di queste RNA polimerasi sono diversi. L'RNA polimerasi I riconosce i promotori a monte tra -45 e +25 regioni nel DNA. L'RNA polimerasi II riconosce i promotori a monte tra -25 e -100 regioni del DNA come (scatola TATA, scatola CAAT e scatola GC). L'RNA polimerasi III riconosce i promotori interni a valle.

Figura 02: RNA polimerasi eucariotica

Le RNA polimerasi eucariotiche sono un grande complesso costituito da proteine multi-subunità di 500 kDa o più. Hanno diversi fattori di trascrizione per il processo di iniziazione e il processo di allungamento come, TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFIIJ. La polimerizzazione dell'RNA termina con RNA polimerasi I dopo aver riconosciuto la scatola di Sal. La terminazione di polimerizzazione dell'RNA mediante RNA polimerasi II avviene dopo aver riconosciuto i segnali a valle noti come coda polyA. E l'RNA polimerasi III riconosce i residui di desossiadenilato sul modello e termina la trascrizione. L'mRNA eucariotico è sempre monocistronico.

Quali sono le somiglianze tra la RNA polimerasi procariotica ed eucariotica?

Entrambi sono coinvolti nella sintetizzazione dell'RNA.
Entrambi stanno usando il DNA come modello.
Entrambe sono grandi proteine.
Entrambi hanno un fattore sigma che avvia la trascrizione.
Entrambi hanno fattori di trascrizione che regolano i passaggi (iniziazione e allungamento) della polimerizzazione dell'RNA.

Qual è la differenza tra procariotica ed eucariotica RNA polimerasi?

Polimerasi di RNA procariotico vs eucariotico
L'RNA polimerasi procariota è un singolo enzima di tipo multi-subunità responsabile della trascrizione procariotica.	Le RNA polimerasi Eukaryotic sono diversi tipi di enzimi che effettuano la trascrizione eucariotica.
Peso molecolare
Il peso molecolare dell'RNA polimerasi procariota è approssimativamente 400 KDa.	Il peso molecolare dell'RNA polimerasi Eukaryotic è superiore a 500kD.
Fattori di trascrizione
L'RNA polimerasi procariota ha fattori di trascrizione come sigma factor e nusA.	Le RNA polimerasi Eukaryotic hanno diversi fattori di trascrizione per l'iniziazione e l'allungamento come; TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFIIJ
Fattore di terminazione
L'RNA polimerasi procariota ha "fattore rho" per la terminazione.	Le RNA polimerasi eucariotiche hanno sequenze di terminazione diverse come la scatola di sal, la coda di poli A, i residui di desossiadenilato.
promotori
L'RNA polimerasi procariota riconosce il promotore nella regione da -10 a -35 nel DNA noto come scatola TATA.	Le RNA polimerasi Eukaryotic riconoscono diversi promotori¹.
Natura dell'mRNA
La RNA polimerasi procariotica produce mRNA policistronico.	L'RNA polimerasi Eukaryotic II produce mRNA monocistronico.

¹ RNA polimerasi I riconosce i promotori a monte tra il -45 e +25 regioni del DNA. RNA polimerasi II riconosce i promotori a monte tra -25 e -100 regioni in DNA come (scatola TATA, scatola CAAT e scatola GC). RNA polimerasi III riconosce i promotori interni a valle.

Sommario - Polimerasi di RNA procariotico vs eucariotico

L'RNA polimerasi è l'enzima responsabile della polimerizzazione dell'RNA noto come trascrizione nella cellula vivente. La RNA polimerasi viene anche chiamata RNA polimerasi diretta dal DNA poiché usa il DNA come modello. Nella trascrizione RNA polimerasi normalmente apre il DNA a doppio filamento in modo che un filamento di DNA possa essere usato come modello per il processo di sintesi della molecola di RNA. L'RNA polimerasi può dare origine a mRNA, rRNA e tRNA. Fattori di trascrizione e complesso mediato dalla trascrizione stanno guidando la RNA polimerasi nel processo di trascrizione. La trascrizione ha tre passaggi; iniziazione, allungamento e fine. Questo può essere evidenziato come la differenza tra Procariotica ed Eukaryotic RNA Polymerase.

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Riferimento:

1. Notizie sulla natura, gruppo editoriale della natura. Disponibile qui
2. "RNA polimerasi." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 11 dic. 2017. Disponibile qui

Cortesia dell'immagine:

1.'RNAP TEC small'By Abbondanzieri, (Public Domain) via Commons Wikimedia
2.'Label RNA pol II 'di JWSchmidt, (dominio pubblico) via Commons Wikimedia

Biologia molecolare