Differenza tra inserimento e vettori di sostituzione

Il differenza fondamentale tra i vettori di inserzione e di sostituzione è che il vettore di inserimento ha la capacità di inserire lunghezze moderate di DNA estraneo mentre il vettore di sostituzione ha la capacità di adattarsi a lunghezze maggiori di DNA estraneo.

I vettori di fago sono i batteriofagi utilizzati per la clonazione. Esistono due tipi di vettori di fago; sono vettore di inserimento e vettore di sostituzione. Inoltre, tutti i vettori dei fagi sono costituiti da geni non essenziali. Tuttavia, questi geni devono essere rimossi dai fagi per facilitare nuovi inserimenti di DNA estranei.

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cosa sono i vettori di inserimento
3. Cosa sono i vettori di ricambio
4. Somiglianze tra i vettori di inserimento e di sostituzione
5. Confronto affiancato - Inserimento vs Vettori di sostituzione in forma tabulare
6. Sommario

Che cos'è un vettore di inserimento?

Innanzitutto, il vettore di inserimento è la forma più semplice di vettori di clonazione lambda. In realtà, è un tipo di vettore dei fagi che ha un unico sito di restrizione introdotto all'interno del genoma del vettore nella posizione del DNA opzionale. Inoltre, il DNA fagico rimane senza rimozione. Questa non rimozione del DNA fagico riduce la dimensione degli inserti (DNA estraneo) da clonare all'interno del vettore. Inoltre, questi vettori sono utili nella clonazione e nell'espressione di cDNA. GT10, GT11 e Zap sono esempi di questo vettore.

Figura 01: Lambda Phage

Il vettore di inserimento consiste in un singolo sito di riconoscimento. La funzione principale di questo vettore è lo sviluppo di librerie di cDNA derivate da sequenze di mRNA eucariotiche. Inoltre, può contenere solo lunghezze di DNA estraneo comprese tra 05-11 kb. Inoltre, possiede un sito di clivaggio unico per l'inserimento di DNA estraneo.

Cosa sono i vettori di ricambio?

Vettore di sostituzione o vettore di sostituzione è un tipo di vettore fagico sviluppato dalla rimozione di una regione centrale del frammento di DNA del fago. L'inserto di DNA estraneo desiderato sostituisce il DNA dei fagi.

Figura 02: Vettore di sostituzione

I vettori di sostituzione sono importanti nella creazione di librerie genomiche come EMBL4 e Charon40. Questi vettori possono contenere una lunghezza maggiore di DNA estraneo compreso tra 8-24 kb di lunghezza. La regione di riempimento comprende anche un gene che rende il vettore dei fagi non vitale all'interno di un ospite batterico.

Quali sono le somiglianze tra i vettori di inserimento e di sostituzione?

• I vettori di inserimento e sostituzione sono vettori di fago.
• Entrambi i vettori ospitano inserti di DNA estranei.
• Entrambi sono utili nella creazione di librerie di DNA.

Qual è la differenza tra i vettori di inserimento e di sostituzione?

Inserimento vs vettori di sostituzione
Il vettore di inserzione è un tipo di vettore di fago che ha un sito di restrizione introdotto all'interno del genoma del fago nel sito del DNA opzionale.	Il vettore di sostituzione è un tipo di vettore fagico sviluppato dalla rimozione di una regione intermedia del DNA dei faghi
Dimensione dei frammenti di inserimento
05-11 kb di lunghezza	8-24 kb di lunghezza
Frammento di riempimento
Nessun frammento di riempimento	Il frammento di riempimento viene sostituito da un inserto estraneo
Funzione
Importante per creare librerie cDNA	Importante nella creazione di librerie genome
Esempi
GT10, GT11 e Zap sono esempi	EMBL4 e Charon40 sono esempi
Sito di clivaggio
Un sito di clivaggio unico è presente	Il sito di clivaggio contiene geni che non sono essenziali per il ciclo litico

Riepilogo: vettori di inserimento e sostituzione

Entrambi i vettori di inserimento e di sostituzione sono due tipi di vettori di fagi. Entrambi i vettori hanno siti di restrizione che facilitano la sistemazione di nuovi inserti di DNA estranei. I vettori di inserimento sono importanti nella creazione di librerie di cDNA mentre i vettori di sostituzione sono importanti nella creazione di librerie genomiche. Inoltre, i vettori di inserimento ospitano inserti di DNA di lunghezza moderata. Ma i vettori di sostituzione possono ospitare più lunghezze di inserti di DNA estranei. Nel complesso, questa è la differenza chiave tra i vettori di inserimento e di sostituzione.

Riferimento:

1. Hasty, P, et al. "L'efficienza dell'inserzione rispetto al targeting vettoriale sostitutivo varia a diversi loci cromosomici". Biologia molecolare e cellulare, Biblioteca nazionale statunitense di medicina, dicembre 1994, Disponibile qui.
2. "Lambda Insertion Vectors." Biology 335 Lecture Notes - Lambda Vectors, Disponibile qui.
3. "Vettore di sostituzione". Vettore di sostituzione - Terminologia di biologia molecolare per vettore di sostituzione - GenScript, Disponibile qui.

Cortesia dell'immagine:

1. "Lambda phage" di Lizanne Koch - opera proprio con ChemBioDraw (Public Domain) via Commons Wikimedia