Differenza tra DNA genomico e isolamento del DNA plasmidico

Il differenza fondamentale tra il DNA genomico e l'isolamento del DNA plasmidico è che il l'isolamento del DNA genomico è mirato all'estrazione del DNA genomico mentre l'isolamento del DNA plasmidico è mirato all'estrazione del DNA plasmidico dei batteri.

L'isolamento del DNA è un processo chimico utilizzato per isolare il DNA da diverse specie o da diversi campioni. L'isolamento del DNA è importante nelle tecniche di biologia molecolare a valle, come l'elettroforesi su gel, la reazione a catena della polimerasi e le tecniche di sequenziamento del DNA. Pertanto, l'isolamento del DNA è un processo chimico essenziale in studi biologici molecolari. Sulla base dello scopo della ricerca, a volte è necessario isolare il DNA genomico. Inoltre, alcuni studi si concentrano sull'isolamento del DNA plasmidico da batteri. L'isolamento del DNA genomico è il processo di isolamento del DNA genomico da un campione procariotico o eucariotico. I passaggi di isolamento differiscono in base al tipo di cellula in cui il DNA si isola. L'isolamento del DNA plasmidico è il processo di isolamento del DNA plasmidico da una cellula batterica. In confronto all'isolamento del DNA genomico, il processo complessivo è complesso nell'isolamento del DNA plasmidico.

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è l'isolamento del DNA genomico
3. Cos'è l'isolamento del DNA plasmidico
4. Somiglianze tra DNA genomico e isolamento del DNA plasmidico
5. Confronto affiancato - DNA genomico vs isolamento del DNA plasmidico in forma tabulare
6. Sommario

Cos'è l'isolamento del DNA genomico?

L'isolamento del DNA genomico è il processo per estrarre l'intero DNA genomico di un organismo. Questo particolare processo coinvolge tre eventi principali. Sono, lisi cellulare o lisi nucleare, degradazione proteica o proteolisi e precipitazione del DNA genomico. La fase di lisi può essere diversa a seconda del tipo di cellula. Nei procarioti, dal momento che esiste una parete cellulare di peptidoglicano, il primo passo dovrebbe essere la scomposizione della parete cellulare. D'altra parte, negli eucarioti, la fase di lisi comporta la rottura della membrana plasmatica e della membrana nucleare per estrarre il DNA all'esterno. Al contrario, passaggi speciali sono essenziali per lisare le pareti cellulari delle piante e dei funghi.

Figura 01: isolamento del DNA genomico

Di conseguenza, una volta completata la fase di lisi, alla fine il DNA arriverà al supernatante. Allo stesso tempo, la degradazione proteica avviene anche nella soluzione a causa dell'aggiunta di proteinasi K. Il passo successivo è separare il DNA genomico e le proteine ​​degradate l'una dall'altra. Quindi, le proteine ​​degradate si separano per precipitazione permettendo al DNA genomico di rimanere nel supernatante. Dopo la precipitazione delle proteine, il DNA genomico può essere precipitato e risospeso in un buffer adeguato fino a quando non è necessario per l'esperimento.

Il DNA genomico, che è DNA lineare, contiene tutte le informazioni genetiche di un organismo. In altre parole, il genoma è il materiale ereditario di un organismo vivente che è responsabile di tutte le attività strutturali e funzionali della cellula. Consiste in sequenze di DNA codificanti e non codificanti. Quando isola il DNA genomico, include l'intero genoma dell'organismo.

Cos'è l'isolamento del DNA plasmidico?

L'isolamento del DNA plasmidico è un processo speciale e più complicato di isolamento del DNA. I plasmidi sono DNA extracromosomico presente nella maggior parte delle cellule batteriche. Sono DNA circolare dormiente che supporta i batteri per sopravvivere in condizioni ambientali difficili. Il DNA plasmidico è costituito da geni resistenti speciali che forniscono ulteriori vantaggi ai batteri come resistenza agli antibiotici, proprietà di virulenza e proprietà tossiche.

Figura 02: isolamento del DNA plasmidico

L'isolamento del DNA plasmidico coinvolge anche tre processi principali; lisi cellulare, proteinolisi e precipitazione del DNA. Sebbene il meccanismo biochimico di isolamento sia simile a quello dell'isolamento del DNA genomico, il processo è più complesso di quello. Il processo di lisi cellulare è il processo più importante in questa procedura. Soprattutto, il DNA genomico e il DNA plasmidico non devono essere mescolati l'uno con l'altro. Pertanto, un processo di lisi molto più lieve incorpora nella procedura di isolamento del DNA plasmidico. Quindi, nella maggior parte delle procedure di isolamento del DNA plasmidico utilizzare il detergente; sodio dodecil solfato per la lisi cellulare.

Quali sono le somiglianze tra il DNA genomico e l'isolamento del DNA plasmidico?

• L'isolamento del DNA genomico e del plasmide si concentrano sull'estrazione del DNA di un organismo.
• Inoltre, entrambi seguono lo stesso processo globale che include la lisi cellulare, la degradazione delle proteine ​​e la precipitazione del DNA.
• Inoltre, il DNA risultante di entrambi i processi è importante per i processi a valle.
• Inoltre, entrambi i processi di isolamento includono i passaggi per purificare e immagazzinare il DNA in condizioni di conservazione specificate.
• Inoltre, la proteinasi K è utilizzata in entrambi i metodi per degradare le proteine.

Qual è la differenza tra il DNA genomico e l'isolamento del DNA plasmidico?

L'isolamento del DNA genomico si concentra sull'estrazione dell'intero DNA genomico dell'organismo bersaglio mentre l'isolamento del DNA plasmidico si concentra sull'isolamento del solo DNA plasmidico dalla particolare specie batterica. Pertanto, questa è la differenza chiave tra il DNA genomico e l'isolamento del DNA plasmidico. Inoltre, un'altra procedura tra il DNA genomico e l'isolamento del DNA plasmidico è nella procedura. L'isolamento del DNA genomico è una procedura meno complessa rispetto all'isolamento del DNA plasmidico. Quindi, quando si isola il DNA plasmidico, è necessario prendere precauzioni per impedire la miscelazione del DNA genomico e plasmidico tra loro.

Il sotto infograo fornisce ulteriori dettagli sulla differenza tra il DNA genomico e l'isolamento del DNA plasmidico.

Riassunto - DNA genomico vs isolamento del DNA plasmidico

L'isolamento del DNA è un processo importante nelle tecniche di biologia molecolare. Esistono due tipi di DNA: DNA genomico e DNA plasmidico (DNA extra-cromosomico). In base al requisito, alcune procedure sono state eseguite per isolare il DNA genomico mentre alcune procedure si sono concentrate sull'isolamento del DNA plasmidico dai batteri. Quindi, i passaggi coinvolti in entrambi i processi differiscono leggermente l'uno dall'altro. Tuttavia, il processo complessivo è lo stesso in entrambi gli isolamenti. Il DNA isolato di entrambi i processi ha un uso immenso nei processi a valle come la clonazione, l'elettroforesi su gel e le reazioni a catena della polimerasi. Alla fine del protocollo di isolamento del DNA genomico, l'intero DNA genomico dell'organismo può essere isolato come prodotto finale mentre alla fine del protocollo di isolamento del DNA plasmidico, il DNA plasmidico del rispettivo batterio può essere isolato come prodotto finale. Pertanto, questa è la differenza tra il DNA genomico e l'isolamento del DNA plasmidico.

Riferimento:

1. "L'ESTRAZIONE DEL DNA DAI BATTERI". Estrazione del DNA dai batteri. Disponibile qui 

Cortesia dell'immagine:

1. "DNA Extraction" di Joo Nath - Opera propria, (CC BY-SA 4.0) attraverso Commons Wikimedia 
2. "Plasmid miniprep" di Retama - Opera propria, (CC BY-SA 4.0) attraverso Commons Wikimedia