La trascrizione è il processo di conversione delle informazioni genetiche memorizzate nella sequenza del DNA codificante nella sequenza dell'mRNA. Una specifica regione di DNA situata all'estremità 5 'dell'unità trascrizionale avvia questo processo. Quella regione è conosciuta come la regione promotrice. Questi promotori si trovano tipicamente adiacenti al sito di inizio della trascrizione. La lunghezza di un promotore varia da 100 bp a 1000 bp. I promotori sono diversi secondo l'organismo tipo. I promotori eucarioti e procarioti sono diversi l'uno dall'altro. Nei procarioti si trovano solo tre tipi di sequenze di promotori, cioè -10 promotoreS, -35 promotore e elementi a monte. Nel eucarioti, ci sono molti diversi elementi promotore come la scatola TATA, gli elementi dell'iniziatore, la scatola GC, la scatola CAAT, ecc. Questo è il differenza fondamentale tra promotori eucariotici e procarioti.
1. Panoramica e differenza chiave
2. Cosa sono i promotori eucarioti
3. Cosa sono i promotori procarioti
4. Somiglianze tra promotori eucarioti e procarioti
5. Confronto affiancato - promotori eucarioti vs procarioti in forma tabulare
6. Sommario
Tre porzioni principali; promotore del nucleo, promotore prossimale e promotore distale, formano collettivamente un promotore. Nel contesto degli eucarioti, ci sono molti elementi promotori molto sofisticati e diversificati rispetto ai promotori. È stato scoperto che, a causa di questa complessità dei promotori eucariotici, il DNA ha la capacità di ripiegarsi su se stesso. Ciò spiega anche il fatto che, l'effetto di molte sequenze regolatorie avviene anche se sono localizzate molte kilobasi lontano dal sito di trascrizione. Questi promotori eucariotici hanno la capacità di attraversare una vasta gamma di sequenze di DNA.
Figura 01: promotore eucariotico
Esempi per alcuni promotori eucariotici sono la scatola Pribnow (scatola TATA), la scatola GC, la scatola CAAT ecc. Nel contesto di Scatola TATA, è una sequenza di 5 '- TATAA -3' che è presente nella regione principale del promotore. Alla scatola TATA sono legate le proteine del fattore di trascrizione e le proteine istoniche. Il legame delle proteine del fattore di trascrizione alla scatola TATA aiuta nel legame della RNA polimerasi, che quindi porta alla formazione del complesso di trascrizione. In termini semplici, il legame di queste proteine guiderà il processo di trascrizione. Questo processo sarà inibito quando le proteine istoniche si legheranno alla scatola TATA. Pertanto, la scatola TATA è un importante elemento promotore che coinvolge nella regolazione del tasso di trascrizione eucariotica.
Negli organismi procarioti, il promotore che coinvolge nella trascrizione è identificato dal fattore associato chiamato fattore sigma. I fattori Sigma sono unici per diverse sequenze del promotore. Pertanto, si dice che ogni singolo fattore sigma riconoscerebbe una singola sequenza di promotore centrale. Questa è una caratteristica unica che è presente nel processo di trascrizione procariota. Sia la RNA polimerasi che il fattore sigma identificano collettivamente la corretta regione del promotore e formano il complesso trascrizionale.
Il promotore procariotico contiene solo tre tipi di elementi promotori. Il minore coinvolgimento degli elementi promotori nei procarioti è la ragione principale per cui il loro processo di trascrizione è meno sofisticato rispetto alla trascrizione eucariotica che coinvolge un numero più elevato di sequenze del promotore. Dei tre elementi promotori dei procarioti, ci sono due principali due brevi sequenze di DNA. Queste sequenze sono classificate in base alla loro posizione. Sono, -10 promotori o elementi (che è presente 10bp a monte del sito di inizio della trascrizione), -35 promotori o elemento (che è presente a monte del sito di inizio della trascrizione 35bp).
Figura 02: Promotore procariotico
Il promotore -10 è equivalente alla scatola TATA eucariotica o alla scatola Pribnow ed è un componente essenziale per l'inizio della trascrizione nei procarioti. Il promotore -35 consiste in una sequenza che è TTGACA che coinvolge attivamente nella regolazione del tasso di trascrizione procariota.
Promotori eucarioti vs procarioti | |
I promotori eucariotici sono le sequenze regolatrici che avviano la trascrizione degli organismi eucarioti. | I promotori procariotici sono le sequenze regolatrici che avviano la trascrizione dei geni procariotici. |
Elementi | |
Il promotore procariotico è costituito da elementi a monte, elementi -10 e -35 elementi. | Il promotore eucariotico è costituito da scatola Pribnow (scatola TATA), scatola CAAT, scatola GC e elementi iniziatore. |
Un promotore è una regione di DNA che implica l'inizio del processo chiamato trascrizione. Questi promotori sono in genere trovati a monte del sito di inizio della trascrizione. Le tre porzioni principali che formano un promotore sono il promotore principale, il promotore prossimale e il promotore distale. Nel contesto degli eucarioti, ci sono molti elementi promotori nella regione del promotore che sono altamente sofisticati e più diversi dei procarioti. Esempi di alcuni elementi promotori eucariotici sono la scatola di Pribnow (scatola TATA), la scatola di GC, la scatola CAAT ecc. Nei procarioti ci sono due principali elementi promotori importanti: l'elemento -10 (che è presente 10bp a monte del sito di inizio della trascrizione), -35 elementi (che è presente 35bp a monte del sito di inizio della trascrizione). -10 promotore avvia la trascrizione e il promotore -35 regola la trascrizione. Entrambi i tipi di promotori sono controllati da sequenze regolatorie del DNA diverse che includono potenziatori, silenziatori, isolanti e elementi di confine. Questa è la differenza tra promotori eucarioti e procarioti.
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1.Kanhere, A. "Proprietà strutturali dei promotori: somiglianze e differenze tra procarioti ed eucarioti." Nucleic Acids Research, vol. 33, no. 10, febbraio 2005, pp. 3165-3175., Doi: 10,1093 / nar / gki627.
2. "Promotori". Addgene. Disponibile qui
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2. 'Figura 15 02 01' di CNX OpenStax, (CC BY 4.0) attraverso Commons Wikimedia