La clonazione del DNA è un processo importante che consente la propagazione di importanti frammenti di DNA di organismi. Richiede l'unione di DNA specifico con DNA vettoriale per creare DNA ricombinante che si trasforma nell'organismo ospite. Un vettore è una molecola di DNA che si comporta come un veicolo per trasportare materiale genetico estraneo in un'altra cellula o organismo. Dovrebbe essere in grado di replicarsi all'interno dell'organismo ospite e produrre copie multiple del DNA ricombinante. Esistono diversi tipi di vettori utilizzati nella clonazione del DNA. Il cromosoma artificiale del lievito (YAC) e il vettore del fago M13 sono di due tipi. La differenza chiave tra il vettore dei fago YAC e M13 è quella YAC è un cromosoma artificiale che si replica nelle cellule di lievito mentre Il vettore di fago M13 è un DNA circolare a filamento singolo di batteriofago M13 che si replica in E Coli cellule.
CONTENUTO
1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è YAC
3. Che cos'è M13 Phage Vector
4. Confronto fianco a fianco - YAC vs M13 Vector Phage
5. Sommario
YAC è un cromosoma costruito artificialmente che ha la capacità di trasportare un ampio segmento di DNA estraneo e replicarsi all'interno delle cellule di lievito. Ha sequenze centromeriche, telomeri e replicanti in modo autonomo, essenziali per la replicazione e la stabilità. YAC dovrebbe anche portare un marcatore selettivo o marcatori e siti di restrizione per renderlo un vettore di clonazione efficace. Grandi sequenze che vanno da 1000 kb a 2000 kb possono essere inserite in YAC e trasferite in lievito.
Figura 01: Vettore YAC
Bacteriophage M13 è un virus che infetta e si replica in E Coli. Il genoma del batteriofago M13 è di piccole dimensioni, circa 6,7 kb. È un DNA a singolo filamento, circolare e positivo. Questo virus infetta specificamente E Coli batteri attraverso F pilus. Una volta che entra nello ssDNA nel batterio, sintetizza il suo filamento complementare e diventa dsDNA o la forma replicativa (RF) di M13. La RF può comportarsi come un plasmide all'interno dell'organismo ospite. Il dsDNA si replica all'interno E Coli e produce ssDNA portante nuovi fagi. Questi nuovi fagi sono continuamente rilasciati dal E Coli senza uccidere la cellula ospite. Tuttavia, l'infezione rallenta la crescita di E Coli. dsDNA può essere estratto da cellule batteriche e utilizzato come vettori nella clonazione del DNA. Sono conosciuti come vettori di fago M13. Possono essere facilmente manipolati e utilizzati in modo simile ai vettori plasmidici.
La capacità intrinseca di infezione di questi fagi M13 serve da buona qualifica per essere utilizzata come vettore nella clonazione del gene. Quando si sviluppa M13 in un vettore, diversi elementi dovrebbero essere incorporati nel suo genoma. Sono, un gene per la proteina lac repressore (lac I), la regione operatore-prossimale del lac Z gene, un promotore lac e un sito di clonazione multipla (polylinker). Quando dsDNA dell'M13 viene usato come vettori, può essere trattato come un vettore plasmidico. Tuttavia, l'uso di ssDNA M13 ha vantaggi nel sequenziamento del DNA e nella mutagenesi sito-diretta.
Dal momento che il vettore di fago M13 porta più siti di clonazione in lacZ regione, i vettori ricombinati possono essere facilmente identificati dallo screening della colonia blu / bianca su piastre di agar contenenti IPTG e X-Gal. Le placche blu prodotte sulle piastre non contengono i fagi ricombinati. Pertanto, i fagi con inserti possono essere selezionati per lo scopo della clonazione.
Figura 02: batteriofago M13
YAC vs M13 Phage Vector | |
YAC è un cromosoma geneticamente modificato che ha la capacità di trasportare un ampio segmento di DNA estraneo e replicarsi all'interno delle cellule di lievito. | Il vettore di fago M13 è un vettore virale sviluppato dal batteriofago M13 che viene utilizzato per inserire il DNA estraneo in E Coli. |
Scopo | |
Le YAC sono state progettate per clonare grandi frammenti di DNA genomico in lievito. | I vettori di fago M13 sono usati per inserire DNA estraneo in E Coli. |
Inserisci lunghezza | |
Gli YAC possono contenere inserti genomici di dimensioni megabase (1000 kb - 2000 kb). | La dimensione degli inserti è di circa 1.500 bps. |
Costruzione | |
Il DNA YAC è difficile da purificare intatto e richiede un'alta concentrazione per generare un sistema vettoriale YAC. | Si verifica tramite la catena di elettroni fotosintetici ciclici. |
Stabilità | |
YAC è instabile. | I fagi M13 possono essere facilmente estratti. |
Taglia | |
Gli enzimi sono molecole più grandi. | I fagi M13 sono stabili rispetto a YAC. |
YAC è un sistema vettoriale costruito artificialmente che utilizza una regione specifica di cromosoma del lievito per inserire ampi segmenti di materiale genetico nelle cellule di lievito. Il vettore di fago M13 è un sistema vettoriale derivato dal batteriofago M 13 che utilizza E coli come l'organismo ospite. Questa è la principale differenza tra YAC e M13 Phage Vector. Entrambi sono ugualmente utili nella tecnologia del DNA ricombinante e nella clonazione genica.
Riferimento:
1. "Vettore". Genetica-note - Vettore. N., n. Web. 16 maggio 2017. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Cromosoma artificiale di lievito". Wikipedia. Wikimedia Foundation, 21 aprile 2017. Web. 16 maggio 2017. .
Cortesia dell'immagine:
1. "M13B" di J3D3 - Opera propria (CC BY-SA 3.0) attraverso Commons Wikimedia