Differenza tra DNA a monte ea valle

Differenza chiave - DNA upstream vs downstream
 

È importante avere una conoscenza generale della composizione e della struttura del DNA per comprendere la differenza tra DNA a monte e a valle. Il DNA è composto da catene polinucleotidiche. I nucleotidi sono i mattoni che creano le catene polinucleotidiche e ciascun nucleotide è costituito da tre componenti: uno zucchero a cinque atomi di carbonio, una base azotata e un gruppo fosfato. Un gruppo fosfato e un gruppo OH sono attaccati al carbonio posizione 5 'e carbonio posizione 3' della molecola di zucchero in un nucleotide, rispettivamente. I nucleotidi sono uniti tra loro da legami fosfodiesteri formati tra 5 'gruppo fosfato di un nucleotide e 3' gruppo OH del nucleotide adiacente. Se una catena polinucleotidica ha un gruppo fosfato 5 'libero, viene assegnata come estremità 5'; se ha un gruppo 3 'OH libero, viene assegnato come fine 3'. Pertanto, i filamenti di DNA hanno solitamente estremità 5 'e 3' secondo le posizioni finali delle catene polinucleotidiche. Il DNA esiste anche come forma a doppio filamento. Due filamenti sono antiparalleli tra loro. Pertanto, il DNA ha due filamenti che vanno verso la direzione da 5 'a 3' e da 3 'a 5'. Il DNA a monte ea valle è riferito con riferimento alla trascrizione e alla sintesi del filamento di mRNA da 5 'a 3'. Se il DNA è considerato verso la fine 5 del codice di codifica dal sito di inizio della trascrizione, è noto come DNA a monte. Se il DNA è considerato verso l'estremità 3 'dal filamento codificante dal sito di inizio della trascrizione è noto come DNA a valle. Questa è la differenza chiave tra DNA a monte e a valle.

CONTENUTO
1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è il DNA upstream
3. Cos'è il DNA a valle
4. Confronto fianco a fianco - DNA upstream vs downstream
5. Sommario

Cos'è il DNA upstream?

Un gene è un'eredità di unità strutturale e funzionale che è situata su DNA di un organismo. Viene memorizzato con le istruzioni per costruire una proteina. Il gene ha una regione specifica di una molecola di DNA. Quando richiesto, trascrive e traduce in una proteina tramite sintesi di un filamento di mRNA. Normalmente un filamento codificante del gene va dalla direzione 5 'a 3'. Quando è trascritto, produce un filamento di mRNA nella stessa direzione da 5 'a 3'. Durante la trascrizione, il filamento antisenso da 3 'a 5' è servito come filamento modello e inizia la sintesi dell'mRNA. C'è un sito di iniziazione della trascrizione nel gene. Con riferimento al sito di iniziazione della trascrizione, la regione del DNA verso l'estremità 5 'del filamento codificante è nota come DNA a monte. Un promotore del gene si trova normalmente nella regione a monte del DNA. Nei geni eucariotici ci sono scatole TATA, elementi prossimali del promotore e potenziatori nell'area a monte del gene. La regione a monte del gene è riferita con numeri negativi. Il DNA a monte di un gene è della massima importanza per la trascrizione.

Cos'è il DNA a valle?

Il sito di iniziazione della trascrizione è noto come +1 punto di un gene. La regione del DNA da 1 punto verso l'estremità 3 'del filamento codificante è nota come DNA a valle. In altre parole, a valle del gene proviene dal sito di iniziazione della trascrizione verso l'estremità 5 'del filo modello. Pertanto, il DNA a valle di una regione genica include unità trascrizionale e altre sequenze come la sequenza terminatrice. Il promotore può influenzare la sequenza a valle di un gene. La parte a valle di un gene è indicata con numeri positivi. Il DNA a valle di un gene è la regione attuale che dà il prodotto proteico.

Figura 01: DNA a monte ea valle

Qual è la differenza tra DNA Upstream e Downstream?

DNA upstream vs downstream
La regione del DNA verso l'estremità 5 'della sequenza di codifica dal sito di inizio della trascrizione è nota come DNA a monte.	La regione del DNA verso l'estremità 3 'della sezione codificante dal sito di inizio della trascrizione è nota come DNA a valle.
Elementi
Promotori e promotori si trovano nel DNA a monte	L'unità di trascrizione e le sequenze di terminazione si trovano nel DNA a valle.
Numerazione
I nucleotidi nella regione a monte sono indicati con numeri negativi	I nucleotidi sono indicati con numeri positivi.
Funzione
Questa regione contiene gli elementi necessari per regolare e avviare la trascrizione	Questa regione contiene istruzioni per produrre una proteina e terminare la trascrizione

Riassunto - DNA upstream vs downstream

È facile identificare a monte ea valle di un filamento di RNA. Per quanto riguarda il sito di riferimento, la regione verso l'estremità 5 'del filamento di RNA è nota come RNA a monte mentre la regione verso l'estremità 3' è nota come RNA a valle. Tuttavia, nel DNA, ci sono due filamenti che corrono in entrambe le direzioni da 5 'a 3' e da 3 'a 5'. Quindi, la differenza tra DNA a monte e a valle è complicata. Pertanto, è differenziato con riferimento alla trascrizione di un gene. Dal sito di iniziazione della trascrizione verso la parte 5 del filamento dei sensi, la regione del DNA è nota come DNA a monte mentre dal sito di inizio della trascrizione verso l'estremità 3 'del filamento dei sensi è noto come DNA a valle. Questa è la differenza tra monte e valle del DNA.

Riferimenti:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi e Jonatha M. Gott. "Ruoli distinti per le sequenze a monte ea valle dei siti di Physarumediting." RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, settembre 2009. Web. 18 marzo 2017

Cortesia dell'immagine:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro e Luísa Romão. "Gene Expression Regulation di Upstream Open Reading Frames and Human Disease." Genetica PLOS. Biblioteca pubblica delle scienze, n. Web. 18 marzo 2017.