Differenza tra trasposone e retrotrasposone

Transposon vs Retrotransposon

I trasposoni e i retrotrasposoni sono componenti genetiche del DNA e vi sono grandi differenze tra loro. La presenza percentuale di questi materiali genetici varia tra le specie e le loro funzioni determinano i destini dell'organismo con mutazioni e altri cambiamenti fenotipicamente importanti. I trasposoni e i retrotrasposoni sono geni o raccolte di determinati geni localizzati nei filamenti di DNA, e le alterazioni delle loro posizioni sono state le cause principali di queste conseguenze. Tuttavia, questo articolo intende discutere brevemente le funzioni di questi geni e presenta un confronto tra i trasposoni e i retrotrasposoni.

Cos'è il Transposon?

I trasposoni sono frammenti interessanti o segmenti di DNA con la possibilità di modificare la posizione del filamento di DNA sotto forma di meccanismo di taglia e incolla. A causa di questa natura mobile dei trasposoni, questi sono conosciuti come geni che saltano. I trasposoni sono di due tipi principali noti come trasposoni di classe I e trasposti di classe II. Di solito, il tipo di Classe II viene indicato come trasposoni e il tipo di Classe I viene indicato come i retrotrasposoni. I processi di taglio e incolla di segmenti mobili di DNA sono regolati dall'enzima trasposasi. L'enzima si lega alle due estremità del trasposone e taglia i legami fosfodiestere del filamento di DNA, isola il trasposone, lo sposta nel sito bersaglio e si lega nella nuova posizione. Tuttavia, questo processo è interessante da comprendere, poiché alcuni trasposoni possono spostarsi solo in determinate posizioni solo a causa dell'incompatibilità delle sequenze di basi con il sito di destinazione. I geni con un'estremità di un singolo filamento hanno la stessa sequenza di base con l'altra estremità dell'altro filamento singolo sono trasposoni con bordi appiccicosi, perché quelli possono legarsi ai siti del filamento di DNA bersaglio con la stessa sequenza di base delle estremità appiccicose . Tuttavia, questa mobilità dei geni può causare cambiamenti del genotipo e del fenotipo dell'organismo. Gli scienziati hanno inventato i trasposoni e gli alimenti e gli organismi geneticamente modificati secondo le personalizzazioni preferite sono stati poi resi disponibili. Colture agricole altamente produttive, antibiotici con proprietà medicinali, animali da allevamento sono stati alcuni dei prodotti sviluppati in modo vantaggioso dopo l'invenzione dei trasposoni di Barbara McClintock negli anni '40.

Cos'è Retrotransposon?

I retrotrasposoni sono i trasposoni di classe I e questi si muovono attraverso il genoma attraverso il meccanismo di copia e incolla. Il meccanismo della mobilità dei retrotrasposoni coinvolge pochi passaggi importanti come la copia del segmento genico del filamento di DNA nell'RNA, il trasferimento della copia dell'RNA nel sito bersaglio, la trascrizione della sequenza dell'RNA nel DNA usando la trascrittasi inversa e l'inserimento del gene nella nuova posizione del filamento di DNA del genoma. Le due estremità di questi retrotrasposoni di solito hanno ripetizioni terminali lunghe con circa 1000 coppie di basi, e quelle sono usate come caratteristiche di identificazione di questi geni. Questi geni sono facilmente amplificati all'interno del genoma e la percentuale dei retrotrasposoni nel genoma umano è di circa il 50%. Questi potrebbero essere piuttosto pericolosi in quanto il virus causale dell'AIDS, dell'HIV e del virus della leucemia a cellule T ha i retrotrasposoni nei loro genomi RNA. In realtà, questi virus possono legare i retrotrasposoni in qualsiasi sito dei filamenti di DNA umano con l'uso della trascrittasi inversa e dell'integrasi. L'enzima integrasi funziona allo stesso modo della trasposasi nei trasposoni di Classe II.