Proteine integrali vs Proteine periferiche
Le proteine sono considerate come macro molecole, che consistono in una o più catene polipeptidiche. Le catene polipeptidiche sono costituite da amminoacidi legati insieme da legami peptidici. La struttura primaria di una proteina può essere determinata dalla sequenza amminoacidica. Alcuni geni codificano per molte proteine. Questi geni determinano la sequenza di amminoacido, determinando in tal modo la loro struttura primaria. Le proteine integrali e periferiche sono considerate come "proteine della membrana plasmatica" a causa del loro verificarsi. Queste proteine sono generalmente responsabili della capacità di una cellula di interagire con l'ambiente esterno.
Proteine integrali
Le proteine integrali si trovano principalmente o completamente o parzialmente immerse nel doppio strato di fosfolipidi della membrana plasmatica. Queste proteine hanno regioni sia polari che non polari. Le teste polari sporgono dalla superficie del doppio strato mentre le regioni non polari sono incorporate al suo interno. Di solito solo le regioni non polari interagiscono con il nucleo idrofobo della membrana plasmatica creando legami idrofobi con le code di acidi grassi dei fosfolipidi.
Le proteine integrali che coprono l'intera membrana dalla superficie interna alla superficie esterna sono chiamate proteine transmembrana. Nelle proteine transmembrana, entrambe le estremità che sporgono dallo strato lipidico sono regioni polari o idrofile. Le regioni centrali sono non polari e hanno amminoacidi idrofobi sulla loro superficie. Tre tipi di interazioni aiutano a incorporare queste proteine nel doppio strato lipidico, cioè le interazioni ioniche con le teste polari di molecole di fosfolipidi, le interazioni idrofobiche con le code idrofobiche di molecole di fosfolipidi e le interazioni specifiche con certe regioni di lipidi, glicolipidi o oligosaccaridi.
Proteine Periferiche
Proteine periferiche (proteine estrinseche) sono presenti sul doppio strato di fosfolipidi più interno e più esterno. Queste proteine sono legate liberamente alla membrana plasmatica direttamente o tramite interazioni con le teste polari di doppio strato di fosfolipidi o indirettamente mediante interazioni con proteine integrali. Queste proteine costituiscono circa il 20-30% delle proteine di membrana totali.
La maggior parte delle proteine periferiche si trovano sulla superficie più interna o sulla superficie citoplasmatica della membrana. Queste proteine rimangono limitate da entrambi attraverso legami covalenti con catene grasse o attraverso un oligosaccaride a fosfolipidi.
Qual è la differenza tra Integral e Protein Peripheral?
• Le proteine periferiche si verificano sulla superficie della membrana plasmatica mentre le proteine integrali si presentano completamente o parzialmente immerse nello strato lipidico della membrana plasmatica.
• Le proteine periferiche sono legate liberamente al doppio strato lipidico e non interagiscono con il nucleo idrofobo tra due strati di fosfolipidi. Al contrario, le proteine integrali sono strettamente legate e interagiscono direttamente con il nucleo idrofobo della membrana plasmatica. Per queste ragioni, la dissociazione proteica integrale è più difficile delle proteine periferiche.
• I trattamenti lievi possono essere utilizzati per isolare le proteine periferiche dalla membrana plasmatica, ma per l'isolamento delle proteine integrali non sono sufficienti trattamenti lievi. Per rompere i legami idrofobi, sono necessari detergenti. Pertanto, le proteine integrali possono essere isolate dalla membrana plasmatica.
• Dopo l'isolamento di queste due proteine dalla membrana plasmatica, le proteine periferiche possono essere disciolte in tamponi acquosi neutri mentre le proteine integrali non possono essere disciolte in tamponi o aggregati acquosi neutri.
• A differenza delle proteine periferiche, le proteine integrali sono associate al lipide quando sono solubilizzate.
• Esempi di proteine periferiche sono la spettrina di eritrociti, citocromo C e ATP-ase di mitocondri e acetilcolinesterasi nelle membrane di elettroplax. Esempi di proteine integrali sono gli enzimi con membrana, i recettori dei farmaci e degli ormoni, l'antigene e la rodopsina.
• Le proteine integrali rappresentano circa il 70% mentre le proteine periferiche rappresentano la porzione rimanente delle proteine della membrana plasmatica.