Agarosio vs poliacrilammide
Ci sono varie differenze relative all'agarosio e alla poliacrilammide, inclusa la loro struttura fisica, la tossicità e i loro metodi di colata, oltre al loro prezzo. È utile conoscere queste differenze, così come le loro somiglianze, se si ha a che fare con uno di questi tipi di gel.
Una delle principali differenze tra questi due gel è che l'agarosio viene versato orizzontalmente, mentre il poliacrilammide viene versato verticalmente. È molto più facile versare l'agarosio in questo modo orizzontale. L'agarosio può essere riscaldato per aiutare il processo di colata, anche se, non dovrebbe essere riscaldato in modo così ampio che l'agarosio finisca per sciogliersi. Si può anche decidere se utilizzare le corsie strette o larghe per versare l'agarosio. Può essere versato utilizzando questo metodo di scanalatura, e questo è uno dei suoi vantaggi. Mentre si versa, si dovrebbe essere estremamente attenti, poiché l'agarosio è molto delicato e può facilmente rompersi.
D'altra parte, come detto, il poliacrilammide viene versato verticalmente. Il poliacrilammide ha bisogno di lastre di vetro per aiutare con questo processo, poiché la sua struttura è molto sottile e questo supporto aggiuntivo è necessario. A differenza dell'agarosio, il poliacrilammide non può essere riscaldato e quindi versato.
L'agarosio è costituito da molte molecole, mentre il poliacrilammide è generalmente costituito da una sola grande molecola. Le molecole di agarosio sono tenute insieme da forze intermolecolari e le molecole sono costituite da DNA. Esistono molecole grandi e piccole e, in generale, le molecole più grandi si separano più facilmente rispetto a quelle più piccole. La molecola di poliacrilammide è costituita da DNA o proteina. Gli spazi tra i gel di poliacrilammide sono inferiori a quelli tra i gel di agarosio, che è un'altra differenza tra queste due sostanze. Dove la dimensione delle bande è la stessa in agarosio, ci sono varie dimensioni di banda in poliacrilammide. Se la molecola di poliacrilammide viene esposta all'aria, non solidificherà in modo uniforme, poiché l'aria fissa il processo di polimerizzazione.
Per quanto riguarda la tossicità, l'agarosio è considerato una sostanza non tossica. Mentre la poliacrilammide è considerata la stessa, la sua polvere è considerata tossica, ed è saggio persino maneggiare i gel con misure protettive.
Il poliacrilammide è utilizzato per il sequenziamento di gel e gel proteici. I suoi vantaggi sono che ha proprietà di colorazione facili e può essere essiccato per formare un gel. Viene acquistato pre-colato, ed è meno costoso di agarosio, a circa $ 5 "7 per gel. (L'agarosio è di circa $ 1 al grammo). Si consiglia a una persona di avere sufficiente esperienza prima di acquistare uno di questi due gel, poiché spesso il numero di campioni richiesti e la concentrazione del gel necessario devono essere noti prima di qualsiasi acquisto.
Sommario:
1. L'arancia viene versata orizzontalmente, mentre il poliacrilammide viene versato verticalmente.
2. L'arancia è più costosa della poliacrilammide.
3. L'agaro è costituito da molte molecole, mentre la poliacrilammide è costituita da una sola grande molecola.
4. A differenza del poliacrilammide, l'agarosio può essere riscaldato nuovamente.
5. L'agaro è considerato una sostanza non tossica in tutte le sue forme, mentre la polvere di poliacrilammide è determinata per essere tossica.