Endonucleasi vs Exonuclease
L'endonucleasi e l'esonucleasi sono enzimi nucleasi che catalizzano l'idrolisi dei singoli nucleotidi presenti in una catena di DNA. Le nuclidi svolgono un ruolo fondamentale nell'analisi della sequenza di nucleotidi nel DNA e nell'RNA.
esonucleasi
Gli enzimi esonucleasi sono una categoria di enzimi che si scindono ai nucleotidi alle estremità della molecola di DNA. I due filamenti del DNA sono complementari l'uno all'altro. Sono rappresentati come braccia 3 'e 5'. I ponti di fosfodiestere di DNA e RNA sono attaccati da due classi di enzimi che sono rappresentati come "a" e "b". Gli enzimi del gruppo "a" idrolizzano specificatamente il legame estere tra 3 'di carbonio e il gruppo fosforico e gli enzimi del gruppo "b" idrolizzano il legame estere tra 5 'di carbonio e il gruppo fosforico.
Un buon esempio di un gruppo "a" enzima di esonucleasi è il veleno di un serpente a sonagli e la vipera di Russell. Questo veleno idrolizza tutti i 3 'legami nel DNA o nell'RNA liberando le unità nucleotidiche come nucleosidi 5' fosfati.
Gli enzimi di classe "b" sono rappresentati dalla fosfodiesterasi della milza che idrolizza tutti i legami "b" o 5 'sia del DNA che dell'RNA e quindi libera solo i fosfati del nucleoside 3'.
endonucleasi
Gli enzimi endonucleasi sono enzimi che si attaccano ai legami del DNA dall'interno della molecola. Non richiedono un gruppo idrossilico libero 3 'o 5' all'estremità della catena polinucleotidica. Le endonucleasi attaccano specifici collegamenti 3 'o 5' ovunque si verifichino nella catena polinucleotidica.
Le endonucleasi sono anche suddivise in gruppi "a" e "b". La deossiribonucleasi I di un pancreas bovino è classificata come un enzima di classe "a" che catalizza l'idrolisi di alcuni dei 3 "legami del DNA per produrre oligonucleotidi contenenti circa quattro residui nucleotidici in media.
La deossiribonucleasi II è un'altra endonucleasi della classe "b". È isolata dalla milza e dal timo di vari batteri e provoca l'idrolisi dei legami di 5 'risultante in un gruppo di nucleotidi.
Sommario:
1. L'esonucleasi provoca l'idrolisi di un nucleotide alle estremità dove è presente un gruppo idrossilico libero 3 'o 5' nella catena polinucleotidica mentre l'esonucleasi non richiede un gruppo idrossilico libero 3 'o 5' per causare l'idrolisi della catena polinucleotidica.
2. L'attività di esonucleasi risulta in nucleosidi mentre l'attività di endonucleasi risulta in oligonucleotidi.
3. L'attività dell'exonuclease si manifesta quasi immediatamente nelle piccole unità della catena polinucleotidica mentre l'attività endonucleasica subisce una fase di latenza prima di rilasciare gruppi di oligonucleotidi.
4. Il veleno di Venere e la fosfodiesterasi di milza sono esempi di esonucleasi mentre la deossiribonucleasi I e II sono esempi di endonucleasi.